RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 CYP2C9P11712 490 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 NKX3-2P78367 333 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 KCNN1Q92952 543 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 PRKCBP05771 671 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 ASGR1P07306 291 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 GNAT1P11488 350 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.185e-10■■□□□ 12.9
ATG4B-204ENST00000402096 PHKA2P46019 1235 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 KCNA10Q16322 511 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 MAPK6Q16659 721 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 RNF180Q86T96 592 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 NLRP7Q8WX94 980 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 A0A087WZ62 844 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 ADSSP30520 456 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 PBX1P40424 430 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MSCO60682 206 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 PTENP60484 403 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 SAAL1Q96ER3 474 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TREHO43280 583 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 KRT13P13646 458 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GARTP22102 1010 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GSDMDP57764 484 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 HIC1Q14526 733 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1W2PQC6 194 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 PIGRP01833 764 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 EDN1P05305 212 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 KCNH2Q12809 1159 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 SYCP1Q15431 976 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.171e-6■■□□□ 12.3
ATG4B-204ENST00000402096 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 PCNTO95613 3336 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GPC3P51654 580 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ADAM17P78536 824 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 POU5F1BQ06416 359 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 HS1BP3Q53T59 392 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GPD1LQ8N335 351 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 GINS2Q9Y248 185 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TPM1P09493 284 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ARID5BQ14865 1188 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ZPBP2Q6X784 338 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF410Q86VK4 478 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 BORCS6Q96GS4 357 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TCHPQ9BT92 498 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 ACKR2O00590 384 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 BFSP1Q12934 665 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 KIZQ2M2Z5 673 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-204ENST00000402096 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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