RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND3A2RUS2 1198 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 PBRM1Q86U86 1689 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 FCER1AP12319 257 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP18Q8N392 663 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 PIGBQ92521 554 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 DPF2Q92785 391 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 IFT43Q96FT9 208 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC22O60826 627 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNQ4P56696 695 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 RFX8Q6ZV50 586 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 AMACRQ9UHK6 382 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 PFASO15067 1338 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 BNIP3LO60238 219 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SDC4P31431 198 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 STAT3P40763 770 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM247A6NEH6 219 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 POU5F1BQ06416 359 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 TEKT2Q9UIF3 430 aa25.66■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ASAP2O43150 1006 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK6Q16659 721 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 EPN3Q9H201 632 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF185O15231 689 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MDH1P40925 334 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA21Q7Z572 469 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC90BQ9GZT6 254 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP10A1A4S6 786 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MTA3Q9BTC8 594 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MAN1A2O60476 641 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA3FQ13275 785 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF568Q3ZCX4 644 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 HLFQ16534 295 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 MTRQ99707 1265 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX12Q9UMY4 172 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 ATICP31939 592 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 IMPG1Q17R60 797 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM167AQ96KS9 214 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM6BO15054 1643 aa25.64■■□□□ 1.7
GNPTAB-201ENST00000299314 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.693e-6■■■■■ 61.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RMDN3Q96TC7 470 aa25.64■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ATXN8OSP0DMR3 200 aa25.64■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDX5P30044 214 aa25.64■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD40Q6AI12 368 aa25.64■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RAPGEF5Q92565 580 aa25.64■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RASSF10A6NK89 507 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TCP11X1B4DZS4 312 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 FLOT2Q14254 428 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL8AQ96BM9 186 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 DONSONQ9NYP3 566 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 AP1B1Q10567 949 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFAF2Q8N183 169 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF17Q9P2E2 1029 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC6O75061 913 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP95Q96GE4 821 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CUL3Q13618 768 aa25.63■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R37O75864 691 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CCZ1BP86790 482 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNA1Q09470 495 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 FEM1BQ9UK73 627 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 STAT4Q14765 748 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 SRLQ86TD4 932 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ARSEP51690 589 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 ALX1Q15699 326 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT76Q01546 638 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 AGPAT1Q99943 283 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 VIPAS39Q9H9C1 493 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 UTYO14607 1347 aa25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNB3P54284 484 aa25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms