RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 MTFR1LQ9H019 292 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 FAM187AA6NFU0 413 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 GAS7O60861 476 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 XRCC4Q13426 336 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 EPC2Q52LR7 807 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP4P98171 946 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 NFIXQ14938 502 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 FYB2Q5VWT5 728 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SLC51AQ86UW1 340 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 NUP85Q9BW27 656 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 GANQ9H2C0 597 aa16.41■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 PHF2O75151 1096 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 MAPK4P31152 587 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 STRN3Q13033 797 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 NID2Q14112 1375 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 C4AP0C0L4 1744 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 C4BP0C0L5 1744 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CCND1P24385 295 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 PTENP60484 403 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 AGAP1Q9UPQ3 857 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ABCB11O95342 1321 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 GOLGA8RI6L899 631 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 GH1P01241 217 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 RASIP1Q5U651 963 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SLFN13Q68D06 897 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 ALG3Q92685 438 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 CYTH2Q99418 400 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 PARVGQ9HBI0 331 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 SERPINB13Q9UIV8 391 aa16.4■□□□□ 0.22
USP25-201ENST00000285679 GDF11O95390 407 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GPC5P78333 572 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SYCP2LQ5T4T6 812 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 FAM228AQ86W67 206 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CARD9Q9H257 536 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 KLHL11Q9NVR0 708 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 GGA1Q9UJY5 639 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ZBTB5O15062 677 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 FMO5P49326 533 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 RWDD2BP57060 319 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CNBD1Q8NA66 436 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 C3orf20Q8ND61 904 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MTMR9Q96QG7 549 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 VCXQ9H320 206 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 RASSF2P50749 326 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 RCN2Q14257 317 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SMC6Q96SB8 1091 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 TRIM4Q9C037 500 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 EMSYQ7Z589 1322 aa16.39■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 BCL9O00512 1426 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ZBTB39O15060 712 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 CYP26A1O43174 497 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SNX3O60493 162 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 DOK7Q18PE1 504 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ANKRD35Q8N283 1001 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 MXD3Q9BW11 206 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 SAYSD1Q9NPB0 183 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 USH1CQ9Y6N9 552 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 DISP2A7MBM2 1401 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 ATP2A1O14983 1001 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PSEN1P49768 467 aa16.38■□□□□ 0.21
USP25-201ENST00000285679 PALB2Q86YC2 1186 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms