RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pick1Q62083 416 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lrrc45Q8CIM1 670 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Asb11Q9CQ31 323 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tcirg1Q9JHF5 834 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cul1Q9WTX6 776 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm3127E9Q9P5 263 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm3453K7N724 263 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Trap1aP19473 224 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 LeprP48356 1162 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Kcna2P63141 499 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Specc1Q5SXY1 1067 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Anks6Q6GQX6 883 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Kctd6Q8BNL5 237 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ccdc15Q8C9M2 810 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Kat5Q8CHK4 513 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tbx22Q8K402 517 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nrbp2Q91V36 499 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rilpl1Q9JJC6 406 aa30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Slc35g2D3YVE8 412 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Q8BGN9 141 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Bco2Q99NF1 532 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ankef1Q9D2J7 775 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Il27raO70394 623 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 CraddO88843 199 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Capn13Q3UW68 665 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gja3Q64448 417 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AdalQ80SY6 360 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fam228aQ8CDW1 299 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Smc6Q924W5 1097 aa30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Vmn2r77L7N2B7 854 aa30.01■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cdk14O35495 469 aa30.01■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Usp4P35123 962 aa30.01■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Trip13Q3UA06 432 aa30.01■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gprin1Q3UNH4 932 aa30.01■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Stoml1Q8CI66 399 aa30.01■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rbm31yQ9D3U4 565 aa30.01■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Abcb11Q9QY30 1321 aa30.01■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Stk10O55098 966 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Surf6P70279 355 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 FancbQ5XJY6 703 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gpr150Q8BL07 427 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sppl3Q9CUS9 384 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rexo2Q9D8S4 237 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 H2-OaQ9QWV1 250 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Scgb2b7D3YYY1 112 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nptx2O70340 429 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lrch1P62046 709 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 GapdhsQ64467 440 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cct8l1Q80YT3 562 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AsphQ8BSY0 741 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dnajc14Q921R4 703 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dph5Q9CWQ0 281 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Adam22Q9R1V6 904 aa30■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cdc25cP48967 447 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rhox12Q4TU81 186 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cyp3a11Q64459 504 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Trim6Q8BGE7 488 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Polr3fQ921X6 316 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rpap3Q9D706 660 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tnip1Q9WUU8 647 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Alkbh1P0CB42 389 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nr1d1Q3UV55 615 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfp91Q62511 572 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Snx14Q8BHY8 964 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Azin2Q8BVM4 459 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pop1Q8K205 1045 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm28036V9GXJ1 658 aa29.99■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rfc1P35601 1131 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Syt2P46097 422 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Opa1P58281 960 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zhx1P70121 873 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Casp7P97864 303 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gdpd4Q3TT99 632 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Spout1Q3UHX9 385 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Krt42Q6IFX2 452 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Acot11Q8VHQ9 594 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Usp21Q9QZL6 566 aa29.98■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Atp2c2A7L9Z8 944 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 MafgO54790 162 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ppp2r5eQ61151 467 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fam187aQ9D3R5 417 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olig1Q9JKN5 260 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mta2Q9R190 668 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm44503E9PYU5 387 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ly9Q01965 654 aa29.97■■■□□ 2.39
Ldb1-208ENSMUST00000185355 MlxipQ2VPU4 917 aa29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.3 ms