Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,81■■■■□ 3,96
H2-OaQ9QWV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
H2-OaQ9QWV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
H2-OaQ9QWV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
H2-OaQ9QWV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
H2-OaQ9QWV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
H2-OaQ9QWV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,32■■■■□ 3,24
H2-OaQ9QWV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
H2-OaQ9QWV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
H2-OaQ9QWV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,24■■■■□ 3,07
H2-OaQ9QWV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,13■■■■□ 3,05
H2-OaQ9QWV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
H2-OaQ9QWV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,76■■■■□ 3
H2-OaQ9QWV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
H2-OaQ9QWV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
H2-OaQ9QWV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
H2-OaQ9QWV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
H2-OaQ9QWV1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
H2-OaQ9QWV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
H2-OaQ9QWV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
H2-OaQ9QWV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
H2-OaQ9QWV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
H2-OaQ9QWV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
H2-OaQ9QWV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
H2-OaQ9QWV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
H2-OaQ9QWV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
H2-OaQ9QWV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
H2-OaQ9QWV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
H2-OaQ9QWV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
H2-OaQ9QWV1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
H2-OaQ9QWV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,54■■■□□ 2,8
H2-OaQ9QWV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,5■■■□□ 2,79
H2-OaQ9QWV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
H2-OaQ9QWV1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
H2-OaQ9QWV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
H2-OaQ9QWV1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
H2-OaQ9QWV1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
H2-OaQ9QWV1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
H2-OaQ9QWV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
H2-OaQ9QWV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
H2-OaQ9QWV1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
H2-OaQ9QWV1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,65■■■□□ 2,66
H2-OaQ9QWV1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
H2-OaQ9QWV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,59■■■□□ 2,65
H2-OaQ9QWV1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,55■■■□□ 2,64
H2-OaQ9QWV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
H2-OaQ9QWV1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
H2-OaQ9QWV1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
H2-OaQ9QWV1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
H2-OaQ9QWV1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
H2-OaQ9QWV1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
H2-OaQ9QWV1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,35■■■□□ 2,61
H2-OaQ9QWV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
H2-OaQ9QWV1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,24■■■□□ 2,59
H2-OaQ9QWV1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
H2-OaQ9QWV1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
H2-OaQ9QWV1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
H2-OaQ9QWV1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
H2-OaQ9QWV1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
H2-OaQ9QWV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
H2-OaQ9QWV1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
H2-OaQ9QWV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
H2-OaQ9QWV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
H2-OaQ9QWV1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,54
H2-OaQ9QWV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,95■■■□□ 2,54
H2-OaQ9QWV1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,94■■■□□ 2,54
H2-OaQ9QWV1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
H2-OaQ9QWV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,94■■■□□ 2,54
H2-OaQ9QWV1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
H2-OaQ9QWV1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,87■■■□□ 2,53
H2-OaQ9QWV1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,79■■■□□ 2,52
H2-OaQ9QWV1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
H2-OaQ9QWV1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,72■■■□□ 2,51
H2-OaQ9QWV1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
H2-OaQ9QWV1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
H2-OaQ9QWV1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
H2-OaQ9QWV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
H2-OaQ9QWV1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,47
H2-OaQ9QWV1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,43■■■□□ 2,46
H2-OaQ9QWV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
H2-OaQ9QWV1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
H2-OaQ9QWV1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
H2-OaQ9QWV1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
H2-OaQ9QWV1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
H2-OaQ9QWV1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
H2-OaQ9QWV1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
H2-OaQ9QWV1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
H2-OaQ9QWV1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
H2-OaQ9QWV1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
H2-OaQ9QWV1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
H2-OaQ9QWV1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,13■■■□□ 2,41
H2-OaQ9QWV1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
H2-OaQ9QWV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
H2-OaQ9QWV1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
H2-OaQ9QWV1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
H2-OaQ9QWV1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
H2-OaQ9QWV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
H2-OaQ9QWV1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
H2-OaQ9QWV1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
H2-OaQ9QWV1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48,1 ms