RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sptlc1O35704 473 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3caP42337 1068 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtpreP49446 699 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bicdl2Q8CHW5 507 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Leng1Q9DB98 261 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnbd1B1AWM0 430 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm3138K7N754 218 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 DmpkP54265 631 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3TTJ4 293 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acad11Q80XL6 779 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ankef1Q9D2J7 775 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fmnl1Q9JL26 1094 aa12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf4bG5E8Z2 855 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Edem3Q2HXL6 931 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nat8lQ3UGX3 299 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Erich4Q3UNU4 136 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clul1Q3ZRW6 464 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 RimklbQ80WS1 387 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Maip1Q8BHE8 291 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 VcpkmtQ8C436 228 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Commd10Q8JZY2 202 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1494Q8VGP8 315 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tll2Q9WVM6 1012 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 NfkbieO54910 364 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp3caP63328 521 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snx27Q3UHD6 539 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr18Q4VBE8 431 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Frmd3Q8BHD4 595 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Frat2Q8K025 231 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcnc4Q8R1C0 628 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 B4galt5Q9JMK0 388 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 PotegA5H0M4 473 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nr1i3O35627 358 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gucy1b3O54865 620 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chmp6P0C0A3 200 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Actn4P57780 912 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 GaaP70699 953 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnpla5Q32LZ8 432 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf579Q80VM4 562 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iqsec1Q8R0S2 961 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oit3Q8R4V5 546 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbm31yQ9D3U4 565 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Msgn1Q9JK54 188 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajc7Q9QYI3 494 aa12.75□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zgrf1Q0VGT4 1863 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm13084A2A8N0 494 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r63E9Q0K5 859 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9268E9Q0M3 861 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r62K7N712 859 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 SarsP26638 512 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mief2Q5NCS9 454 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 ItgaeQ60677 1167 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd37Q61470 281 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim65Q8BFW4 522 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pkn2Q8BWW9 983 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps36Q91XD6 386 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plagl2Q925T4 496 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Luc7lQ9CYI4 371 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina9Q9D7D2 418 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 DgkkE9Q7N4 1118 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 PtenO08586 403 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 HomezQ80W88 542 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina10Q8R121 448 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nmrk1Q91W63 195 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rilpl1Q9JJC6 406 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wnt7bP28047 349 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 rp9P97762 213 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rhox12Q4TU81 186 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp1r1bQ60829 194 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf507Q6ZPY5 941 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ush1gQ80T11 461 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Depdc1bQ8BH88 529 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pnma3Q8JZW8 466 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf6Q9DBU5 667 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 MesdQ9ERE7 224 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp29Q9ES63 869 aa12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 NcapgE9PWG6 1004 aa12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 MycP01108 439 aa12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gjb1P28230 283 aa12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem117Q8BH18 514 aa12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Leg1Q8C6C9 337 aa12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cbwd1Q8VEH6 393 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.1 ms