Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
Gjb1P28230 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Gjb1P28230 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Gjb1P28230 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
Gjb1P28230 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Gjb1P28230 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Gjb1P28230 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Gjb1P28230 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Gjb1P28230 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Gjb1P28230 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Gjb1P28230 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Gjb1P28230 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Gjb1P28230 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Gjb1P28230 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Gjb1P28230 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Gjb1P28230 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Gjb1P28230 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Gjb1P28230 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gjb1P28230 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gjb1P28230 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gjb1P28230 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gjb1P28230 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Gjb1P28230 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Gjb1P28230 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Gjb1P28230 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Gjb1P28230 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Gjb1P28230 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Gjb1P28230 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Gjb1P28230 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gjb1P28230 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Gjb1P28230 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Gjb1P28230 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Gjb1P28230 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Gjb1P28230 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Gjb1P28230 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Gjb1P28230 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Gjb1P28230 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gjb1P28230 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gjb1P28230 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Gjb1P28230 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gjb1P28230 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Gjb1P28230 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Gjb1P28230 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Gjb1P28230 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Gjb1P28230 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Gjb1P28230 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Gjb1P28230 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Gjb1P28230 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Gjb1P28230 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Gjb1P28230 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gjb1P28230 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Gjb1P28230 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Gjb1P28230 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Gjb1P28230 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Gjb1P28230 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gjb1P28230 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Gjb1P28230 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gjb1P28230 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gjb1P28230 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gjb1P28230 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gjb1P28230 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gjb1P28230 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gjb1P28230 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Gjb1P28230 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Gjb1P28230 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gjb1P28230 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Gjb1P28230 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Gjb1P28230 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Gjb1P28230 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Gjb1P28230 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Gjb1P28230 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gjb1P28230 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gjb1P28230 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Gjb1P28230 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Gjb1P28230 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gjb1P28230 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gjb1P28230 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gjb1P28230 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gjb1P28230 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gjb1P28230 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gjb1P28230 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gjb1P28230 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gjb1P28230 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gjb1P28230 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Gjb1P28230 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gjb1P28230 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gjb1P28230 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gjb1P28230 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gjb1P28230 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gjb1P28230 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gjb1P28230 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gjb1P28230 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gjb1P28230 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Gjb1P28230 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gjb1P28230 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gjb1P28230 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Gjb1P28230 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gjb1P28230 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gjb1P28230 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gjb1P28230 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms