Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL26

Fmnl1, Formin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl1Q9JL26 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,73■■■■■ 4,43
Fmnl1Q9JL26 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,93
Fmnl1Q9JL26 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Fmnl1Q9JL26 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,24■■■■□ 3,55
Fmnl1Q9JL26 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,11■■■■□ 3,53
Fmnl1Q9JL26 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,47■■■■□ 3,43
Fmnl1Q9JL26 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Fmnl1Q9JL26 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Fmnl1Q9JL26 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Fmnl1Q9JL26 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Fmnl1Q9JL26 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Fmnl1Q9JL26 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Fmnl1Q9JL26 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Fmnl1Q9JL26 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Fmnl1Q9JL26 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Fmnl1Q9JL26 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Fmnl1Q9JL26 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Fmnl1Q9JL26 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Fmnl1Q9JL26 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Fmnl1Q9JL26 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Fmnl1Q9JL26 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Fmnl1Q9JL26 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Fmnl1Q9JL26 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Fmnl1Q9JL26 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Fmnl1Q9JL26 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Fmnl1Q9JL26 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Fmnl1Q9JL26 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Fmnl1Q9JL26 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,88■■■■□ 3,01
Fmnl1Q9JL26 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Fmnl1Q9JL26 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Fmnl1Q9JL26 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,78■■■■□ 3
Fmnl1Q9JL26 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Fmnl1Q9JL26 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Fmnl1Q9JL26 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,64■■■□□ 2,98
Fmnl1Q9JL26 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Fmnl1Q9JL26 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Fmnl1Q9JL26 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Fmnl1Q9JL26 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Fmnl1Q9JL26 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Fmnl1Q9JL26 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Fmnl1Q9JL26 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Fmnl1Q9JL26 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Fmnl1Q9JL26 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Fmnl1Q9JL26 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Fmnl1Q9JL26 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Fmnl1Q9JL26 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,63■■■□□ 2,81
Fmnl1Q9JL26 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Fmnl1Q9JL26 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Fmnl1Q9JL26 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Fmnl1Q9JL26 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Fmnl1Q9JL26 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Fmnl1Q9JL26 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Fmnl1Q9JL26 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Fmnl1Q9JL26 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Fmnl1Q9JL26 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Fmnl1Q9JL26 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Fmnl1Q9JL26 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Fmnl1Q9JL26 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Fmnl1Q9JL26 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Fmnl1Q9JL26 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,73
Fmnl1Q9JL26 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,04■■■□□ 2,72
Fmnl1Q9JL26 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Fmnl1Q9JL26 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,95■■■□□ 2,71
Fmnl1Q9JL26 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Fmnl1Q9JL26 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Fmnl1Q9JL26 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Fmnl1Q9JL26 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Fmnl1Q9JL26 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Fmnl1Q9JL26 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Fmnl1Q9JL26 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Fmnl1Q9JL26 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Fmnl1Q9JL26 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Fmnl1Q9JL26 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,73■■■□□ 2,67
Fmnl1Q9JL26 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Fmnl1Q9JL26 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Fmnl1Q9JL26 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Fmnl1Q9JL26 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Fmnl1Q9JL26 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Fmnl1Q9JL26 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Fmnl1Q9JL26 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Fmnl1Q9JL26 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,53■■■□□ 2,64
Fmnl1Q9JL26 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Fmnl1Q9JL26 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Fmnl1Q9JL26 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Fmnl1Q9JL26 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Fmnl1Q9JL26 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Fmnl1Q9JL26 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Fmnl1Q9JL26 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Fmnl1Q9JL26 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Fmnl1Q9JL26 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Fmnl1Q9JL26 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Fmnl1Q9JL26 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,61
Fmnl1Q9JL26 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Fmnl1Q9JL26 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,35■■■□□ 2,61
Fmnl1Q9JL26 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Fmnl1Q9JL26 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Fmnl1Q9JL26 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Fmnl1Q9JL26 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Fmnl1Q9JL26 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Fmnl1Q9JL26 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,4 ms