Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
Cntnap5bQ0V8T8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Cntnap5bQ0V8T8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Cntnap5bQ0V8T8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Cntnap5bQ0V8T8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cntnap5bQ0V8T8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cntnap5bQ0V8T8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cntnap5bQ0V8T8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cntnap5bQ0V8T8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cntnap5bQ0V8T8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Cntnap5bQ0V8T8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cntnap5bQ0V8T8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cntnap5bQ0V8T8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cntnap5bQ0V8T8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cntnap5bQ0V8T8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cntnap5bQ0V8T8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Cntnap5bQ0V8T8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cntnap5bQ0V8T8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cntnap5bQ0V8T8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cntnap5bQ0V8T8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cntnap5bQ0V8T8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Cntnap5bQ0V8T8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Cntnap5bQ0V8T8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cntnap5bQ0V8T8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cntnap5bQ0V8T8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cntnap5bQ0V8T8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cntnap5bQ0V8T8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Cntnap5bQ0V8T8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cntnap5bQ0V8T8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Cntnap5bQ0V8T8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cntnap5bQ0V8T8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cntnap5bQ0V8T8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cntnap5bQ0V8T8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cntnap5bQ0V8T8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cntnap5bQ0V8T8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cntnap5bQ0V8T8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cntnap5bQ0V8T8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cntnap5bQ0V8T8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Cntnap5bQ0V8T8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cntnap5bQ0V8T8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cntnap5bQ0V8T8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cntnap5bQ0V8T8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cntnap5bQ0V8T8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cntnap5bQ0V8T8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cntnap5bQ0V8T8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cntnap5bQ0V8T8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cntnap5bQ0V8T8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cntnap5bQ0V8T8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cntnap5bQ0V8T8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cntnap5bQ0V8T8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cntnap5bQ0V8T8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Cntnap5bQ0V8T8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cntnap5bQ0V8T8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Cntnap5bQ0V8T8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cntnap5bQ0V8T8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cntnap5bQ0V8T8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Cntnap5bQ0V8T8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Cntnap5bQ0V8T8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cntnap5bQ0V8T8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cntnap5bQ0V8T8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cntnap5bQ0V8T8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cntnap5bQ0V8T8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cntnap5bQ0V8T8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cntnap5bQ0V8T8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cntnap5bQ0V8T8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms