Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,03■■■■■ 4,32
Snx27Q3UHD6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Snx27Q3UHD6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Snx27Q3UHD6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,84■■■■□ 3,49
Snx27Q3UHD6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Snx27Q3UHD6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,4■■■■□ 3,42
Snx27Q3UHD6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,07■■■■□ 3,36
Snx27Q3UHD6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Snx27Q3UHD6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Snx27Q3UHD6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Snx27Q3UHD6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Snx27Q3UHD6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Snx27Q3UHD6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Snx27Q3UHD6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Snx27Q3UHD6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Snx27Q3UHD6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Snx27Q3UHD6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,28■■■■□ 3,08
Snx27Q3UHD6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Snx27Q3UHD6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Snx27Q3UHD6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Snx27Q3UHD6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,86■■■■□ 3,01
Snx27Q3UHD6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Snx27Q3UHD6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Snx27Q3UHD6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Snx27Q3UHD6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,7■■■□□ 2,99
Snx27Q3UHD6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Snx27Q3UHD6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Snx27Q3UHD6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Snx27Q3UHD6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,55■■■□□ 2,96
Snx27Q3UHD6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Snx27Q3UHD6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Snx27Q3UHD6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Snx27Q3UHD6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Snx27Q3UHD6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Snx27Q3UHD6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,15■■■□□ 2,9
Snx27Q3UHD6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Snx27Q3UHD6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Snx27Q3UHD6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Snx27Q3UHD6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Snx27Q3UHD6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Snx27Q3UHD6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Snx27Q3UHD6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,51■■■□□ 2,79
Snx27Q3UHD6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Snx27Q3UHD6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Snx27Q3UHD6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Snx27Q3UHD6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Snx27Q3UHD6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Snx27Q3UHD6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Snx27Q3UHD6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Snx27Q3UHD6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Snx27Q3UHD6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Snx27Q3UHD6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Snx27Q3UHD6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Snx27Q3UHD6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,02■■■□□ 2,72
Snx27Q3UHD6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Snx27Q3UHD6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Snx27Q3UHD6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Snx27Q3UHD6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Snx27Q3UHD6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Snx27Q3UHD6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Snx27Q3UHD6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Snx27Q3UHD6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Snx27Q3UHD6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Snx27Q3UHD6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Snx27Q3UHD6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Snx27Q3UHD6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Snx27Q3UHD6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Snx27Q3UHD6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Snx27Q3UHD6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Snx27Q3UHD6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Snx27Q3UHD6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,47■■■□□ 2,63
Snx27Q3UHD6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Snx27Q3UHD6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Snx27Q3UHD6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,4■■■□□ 2,62
Snx27Q3UHD6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Snx27Q3UHD6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Snx27Q3UHD6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Snx27Q3UHD6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Snx27Q3UHD6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Snx27Q3UHD6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Snx27Q3UHD6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Snx27Q3UHD6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Snx27Q3UHD6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Snx27Q3UHD6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Snx27Q3UHD6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Snx27Q3UHD6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,13■■■□□ 2,57
Snx27Q3UHD6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Snx27Q3UHD6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Snx27Q3UHD6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Snx27Q3UHD6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Snx27Q3UHD6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Snx27Q3UHD6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Snx27Q3UHD6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Snx27Q3UHD6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Snx27Q3UHD6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Snx27Q3UHD6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Snx27Q3UHD6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Snx27Q3UHD6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Snx27Q3UHD6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Snx27Q3UHD6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,77■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms