Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGX3

Nat8l, N-acetylaspartate synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nat8lQ3UGX3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Nat8lQ3UGX3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Nat8lQ3UGX3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Nat8lQ3UGX3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Nat8lQ3UGX3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Nat8lQ3UGX3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nat8lQ3UGX3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Nat8lQ3UGX3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Nat8lQ3UGX3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Nat8lQ3UGX3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Nat8lQ3UGX3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Nat8lQ3UGX3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Nat8lQ3UGX3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Nat8lQ3UGX3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nat8lQ3UGX3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nat8lQ3UGX3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Nat8lQ3UGX3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nat8lQ3UGX3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Nat8lQ3UGX3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Nat8lQ3UGX3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nat8lQ3UGX3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Nat8lQ3UGX3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Nat8lQ3UGX3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Nat8lQ3UGX3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Nat8lQ3UGX3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Nat8lQ3UGX3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Nat8lQ3UGX3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Nat8lQ3UGX3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Nat8lQ3UGX3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Nat8lQ3UGX3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nat8lQ3UGX3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Nat8lQ3UGX3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Nat8lQ3UGX3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Nat8lQ3UGX3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Nat8lQ3UGX3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Nat8lQ3UGX3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Nat8lQ3UGX3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nat8lQ3UGX3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nat8lQ3UGX3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Nat8lQ3UGX3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nat8lQ3UGX3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nat8lQ3UGX3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nat8lQ3UGX3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nat8lQ3UGX3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Nat8lQ3UGX3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nat8lQ3UGX3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nat8lQ3UGX3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nat8lQ3UGX3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nat8lQ3UGX3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nat8lQ3UGX3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nat8lQ3UGX3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nat8lQ3UGX3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nat8lQ3UGX3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nat8lQ3UGX3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Nat8lQ3UGX3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nat8lQ3UGX3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Nat8lQ3UGX3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nat8lQ3UGX3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nat8lQ3UGX3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nat8lQ3UGX3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nat8lQ3UGX3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Nat8lQ3UGX3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nat8lQ3UGX3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nat8lQ3UGX3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nat8lQ3UGX3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nat8lQ3UGX3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nat8lQ3UGX3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nat8lQ3UGX3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nat8lQ3UGX3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nat8lQ3UGX3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nat8lQ3UGX3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nat8lQ3UGX3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nat8lQ3UGX3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nat8lQ3UGX3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Nat8lQ3UGX3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nat8lQ3UGX3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Nat8lQ3UGX3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Nat8lQ3UGX3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Nat8lQ3UGX3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nat8lQ3UGX3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nat8lQ3UGX3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Nat8lQ3UGX3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Nat8lQ3UGX3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Nat8lQ3UGX3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Nat8lQ3UGX3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Nat8lQ3UGX3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Nat8lQ3UGX3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nat8lQ3UGX3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nat8lQ3UGX3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nat8lQ3UGX3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nat8lQ3UGX3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nat8lQ3UGX3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nat8lQ3UGX3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nat8lQ3UGX3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Nat8lQ3UGX3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nat8lQ3UGX3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nat8lQ3UGX3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nat8lQ3UGX3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nat8lQ3UGX3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nat8lQ3UGX3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms