RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C RIB4P50861 169 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C OKP1P53298 406 aa1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C IRC4Q03036 179 aa1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C INP1Q03694 420 aa1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YMR244WQ04018 355 aa1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C UTP15Q04305 513 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CUR1Q06469 252 aa1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YPR1Q12458 312 aa1.34□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CAR2P07991 424 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ERD1P16151 362 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C FUS3P16892 353 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C TPS2P31688 896 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RAD23P32628 398 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C FMT1P32785 401 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ZRT1P32804 376 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RFT1P38206 574 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C PET8P38921 284 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MNN9P39107 395 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C UFE1P41834 346 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YFL040WP43562 540 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SDS23P53172 527 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C FMP48P53233 369 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C INP2Q03824 705 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C UBX2Q04228 584 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MRX8Q05473 314 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MIM1Q08176 113 aa1.34□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C COX10P21592 462 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YKL187CP34231 750 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ZRT3P34240 503 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YHR035WP38769 630 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C CTM1P38818 585 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C DSE1P40077 573 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RRG9P40156 214 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C VOA1P53262 265 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SNX41Q04053 625 aa1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SAR1P20606 190 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C INO2P26798 304 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C IME2P32581 645 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SKG6P32900 734 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C FRM2P37261 193 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C TRR2P38816 342 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SOP4P39543 234 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C BDH1P39714 382 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C CDC40P40968 455 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YGR266WP53326 701 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C HST4P53688 370 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YNR066CP53752 436 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C APC4Q04601 652 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RRG8Q06109 277 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C VAC14Q06708 880 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YDL211CQ12121 372 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C UTP23Q12339 254 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RAD7P06779 565 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C CKA2P19454 339 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RPB9P27999 122 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C PRY2P36110 329 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C FRT2P39734 528 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MIC19P43594 170 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C LOH1P47055 219 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C ECM19Q06011 112 aa1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP1.32□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RPL5P26321 297 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MCH2P36032 473 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YPC1P38298 316 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YMR262WP38430 313 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SLM1P40485 686 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YIL054WP40524 105 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C LOC1P43586 204 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C COX16P47081 118 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YGL118CP53132 145 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C BIO4P53630 237 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C APC9Q12107 265 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SIA1Q12212 622 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C IZH4Q99393 312 aa1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C BEM2P39960 2167 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data1.3□□□□□ -2.2not detected
HDA3YPR179C CPT1P17898 393 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RPC25P35718 212 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SWD2P36104 329 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C MRPL40P36534 297 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YIR035CP40579 254 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C PNC1P53184 216 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C SWC4P53201 476 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C CAX4P53223 239 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C GMC1Q04399 608 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YLR446WQ06204 433 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C YOR292CQ08743 309 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C VIK1Q12045 647 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C TRM10Q12400 293 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C TFC7Q12415 435 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C LAG2Q92325 660 aa1.3□□□□□ -2.2
HDA3YPR179C RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
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