RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	ASR1	Q06834	288 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YDL242W	Q07746	117 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	TEN1	Q07921	160 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YNG1	Q08465	219 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YPQ1	Q12010	308 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	FMP16	Q12497	93 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SFG1	Q12507	346 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GCN4	P03069	281 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	KIN3	P22209	435 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YIM1	P28625	365 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SUR1	P33300	382 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YBR063C	P38083	404 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YPT10	P38146	199 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	STP2	P38704	541 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YHR177W	P38867	453 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YEL073C	P39974	107 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	JHD1	P40034	492 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SLZ1	P40167	298 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	AAD10	P47182	288 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RRN9	P53437	365 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	TIM10	P87108	93 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	TDA1	Q03533	586 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YOR214C	Q12282	236 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RGT2	Q12300	763 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ATG31	Q12421	196 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	STT4	P37297	1900 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MET2	P08465	486 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YML003W	P0CF16	290 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PET54	P10834	293 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	TRX3	P25372	127 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ATP11	P32453	318 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	HYM1	P32464	399 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	JEN1	P36035	616 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SCO2	P38072	301 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	INM1	P38710	295 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YHR035W	P38769	630 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	FMP10	P40098	244 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SNM1	P40993	198 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ATG18	P43601	500 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	APS3	P47064	194 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PAC10	P48363	199 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YGR266W	P53326	701 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SNZ1	Q03148	297 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SWF1	Q04629	336 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MFB1	Q04922	465 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YML053C	Q04978	212 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YLR283W	Q05867	314 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GPN3	Q06543	272 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	MDM32	Q12171	622 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ERP4	Q12450	207 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	COX3	P00420	269 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SPS2	P08459	502 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	EPT1	P22140	391 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SRB5	P32585	307 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	GGC1	P38988	300 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PHM8	P40025	321 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	VRG4	P40107	337 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	HXT9	P40885	567 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YNL092W	P53934	400 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	DID2	P69771	204 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SEG1	Q04279	960 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RNH202	Q05635	350 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YLR173W	Q06247	608 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YLR036C	Q07986	203 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PUS9	Q12069	462 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	BSC1	Q12140	328 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YBR085C-A	O43137	85 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	COX1	P00401	534 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YCK1	P23291	538 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	LAC1	P28496	418 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ERG9	P29704	444 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SSO1	P32867	290 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	TAF14	P35189	244 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	CBP4	P37267	147 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	IML3	P38265	245 aa		5.2	□□□□□ -1.58

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