RNA–Protein interactions for RNA: YML039W

YML039W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YML039W, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML039WYML039W MRPL36P36531 177 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W IRC22P40006 225 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W TOK1P40310 691 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W PHB1P40961 287 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YGR210CP42942 411 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YPI1P43587 155 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W ZAP1P47043 880 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W GPI8P49018 411 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W BUD9P53226 547 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SUN4P53616 420 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YDC1Q02896 317 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W LOT6Q07923 191 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W REX4Q08237 289 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W TMS1Q12116 473 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W MSI1P13712 422 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W HNM1P19807 563 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W VPS17P32913 551 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W REC104P33323 182 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YAT2P40017 923 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W AIM25P47140 327 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W MGR3Q04472 501 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W VPS74Q06385 345 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W RFU1Q08003 200 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W CCW14O13547 238 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W AAC3P18238 307 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W FUR1P18562 216 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W AMS1P22855 1083 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W MNS1P32906 549 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SOR1P35497 357 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YPS6P40583 537 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SPG5P42933 373 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W USE1P53146 245 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YGR015CP53208 328 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W INN1P53901 409 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W ARK1P53974 638 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YAT1P80235 687 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W FMN1Q03778 218 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YMR087WQ04299 284 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YDR286CQ05530 114 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YPR196WQ06595 470 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SOR2Q07786 357 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W TCO89Q08921 799 aa2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YRF1-2P40105 1681 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W BI2P03873 423 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W HEM13P11353 328 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W RPS1AP33442 255 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.43□□□□□ -2.02not detected
YML039WYML039W YBR013CP38215 129 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W MMM1P41800 426 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SMK1P41808 388 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W BRR6P53062 197 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W PUS2P53167 370 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W RNH1Q04740 348 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SML1Q04964 104 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YLR407WQ06070 228 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W PAM18Q07914 168 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W DCI1Q08558 271 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YPL199CQ08954 240 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SOD2P00447 233 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W RAD10P06838 210 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W GAL7P08431 366 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W MNN2P38069 597 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SPO73P40031 143 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W GIP2P40036 548 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W SET4P42948 560 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YGR042WP53227 271 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W ERG5P54781 538 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W ISU1Q03020 165 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YMR279CQ03263 540 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W THI74Q04083 370 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W RXT3Q07458 294 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W MMT2Q08970 484 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W POM33Q12164 279 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YAR066WP0CX18 203 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YHR214WP0CX19 203 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W CDC10P25342 322 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W ATG15P25641 520 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W HXT1P32465 570 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YSC84P32793 468 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W AHP1P38013 176 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W TCM62P38228 572 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W TDA2P40045 126 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W ALG13P53178 202 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W COG2P53271 262 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W IPI3P53877 555 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W ABF2Q02486 183 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W HED1Q03937 162 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W FAR8Q05040 523 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W UNG1P12887 359 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W PTC6P25646 442 aa2.43□□□□□ -2.02
YML039WYML039W TRK2P28584 889 aa2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 237.9 ms