RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	NIF3	P53081	288 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	GND2	P53319	492 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ATG4	P53867	494 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YNL140C	P53910	189 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YPL080C	Q02826	108 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YDR248C	Q03786	193 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YDR387C	Q04162	555 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	DLT1	Q04216	342 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	IMA2	Q08295	589 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ALE1	Q08548	619 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	JLP1	Q12358	412 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YOR338W	Q99326	363 aa		4	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	KIN3	P22209	435 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ITR2	P30606	609 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	NUP2	P32499	720 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ZRT1	P32804	376 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	MSN2	P33748	704 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SHC1	P39000	512 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	FRT2	P39734	528 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SYG1	P40528	902 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	PHB1	P40961	287 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SFH5	P47008	294 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	TAD2	P47058	250 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	HOC1	P47124	396 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	UBP8	P50102	471 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	PHO23	P50947	330 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CPD1	P53314	239 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SNO1	Q03144	224 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	MMT1	Q03218	510 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	MSS11	Q03825	758 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	PLM2	Q04383	521 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ORM2	Q06144	216 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ASR1	Q06834	288 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YDL086W	Q07505	273 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	NPC2	Q12408	173 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CBS2	P14905	389 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	PTP1	P25044	335 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ATO2	P32907	282 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ARP1	P38696	384 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ATG7	P38862	630 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	DDI1	P40087	428 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ALG8	P40351	577 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	BMT5	P40493	336 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YFH7	P43591	353 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CHA4	P43634	648 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CIN2	P46670	268 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	EAF6	P47128	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	NMA2	P53204	395 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YPR003C	P53394	754 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SUN4	P53616	420 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YNL092W	P53934	400 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YLR460C	P54007	376 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	HER2	Q03557	464 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ARO80	Q04052	950 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CAC2	Q04199	468 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	DXO1	Q06349	442 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	AIM39	Q08223	395 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YPL199C	Q08954	240 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	LCB4	Q12246	624 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	TPK3	P05986	398 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CHO1	P08456	276 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	TYR1	P20049	452 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	VPH2	P32341	215 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	COX13	P32799	129 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YBR056W	P38081	501 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	ROT2	P38138	954 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	SHG1	P38337	142 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	CUE1	P38428	203 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	PHM8	P40025	321 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YIA6	P40556	373 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	YFR057W	P43625	151 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	TRS85	P46944	698 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	APS3	P47064	194 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YRA2	YKL214C	PHB2	P50085	310 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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