RNA–Protein interactions for RNA: YKL034W

TUL1, Transcript of Subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene TUL1, Length 2,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUL1	YKL034W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	IDP2	P41939	412 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YFR020W	P43600	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	COX18	P53239	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	IRC15	Q02733	499 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TRM13	Q12383	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	GPA2	P10823	449 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YCR023C	P25351	611 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	POP5	P28005	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YER076C	P40049	302 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	DDI1	P40087	428 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	MIC26	P50087	233 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	COS6	P53344	381 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	ASI2	P53895	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	ABF2	Q02486	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	CSN9	Q03981	162 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TAF10	Q12030	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	FRE7	Q12333	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	COX1	P00401	534 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	CDC8	P00572	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	RPB8	P20436	146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	SLY1	P22213	666 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	REC114	P32841	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YBR241C	P38142	488 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YBR096W	P38256	230 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	UBP5	P39944	805 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	SAS2	P40963	338 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	GLC8	P41818	229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	GUF1	P46943	645 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	AIM24	P47127	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	UBP8	P50102	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
TUL1	YKL034W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TMN2	Q04562	672 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TEN1	Q07921	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	STH1	P32597	1359 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	SAM35	P14693	329 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	CTA1	P15202	515 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TFC1	P32367	649 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	NUP2	P32499	720 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	GDA1	P32621	518 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	SKN1	P33336	771 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YKL097C	P34245	136 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	ECM15	P35195	104 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	HES1	P35843	434 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	PHD1	P36093	366 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	SCO2	P38072	301 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	FMP23	P38231	175 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	BDH2	P39713	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YCH1	P42937	148 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	PAC10	P48363	199 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	POP6	P53218	158 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	GRX8	Q05926	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TDA6	Q06466	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	RHO2	P06781	192 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	STE14	P32584	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	CIN4	P39110	191 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	FMP52	P40008	231 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TPN1	P53099	579 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	MMS2	P53152	137 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TSA2	Q04120	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	APC9	Q12107	265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TUL1	YKL034W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TUL1	YKL034W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TUL1	YKL034W	HCM1	P25364	564 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TUL1	YKL034W	SLM6	P38343	150 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TUL1	YKL034W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TUL1	YKL034W	ILM1	P47155	203 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TUL1	YKL034W	CWC27	Q02770	301 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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