RNA–Protein interactions for RNA: YGR139W

YGR139W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGR139W, Length 339 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR139W	YGR139W	APC4	Q04601	652 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	FLO11	P08640	1367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	DAP2	P18962	818 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	CKI1	P20485	582 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	HMX1	P32339	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	PCH2	P38126	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	IST2	P38250	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	EOS1	P53938	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	VTI1	Q04338	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	SFG1	Q12507	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	RXT2	P38255	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	NAS6	P50086	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	PRM1	P53835	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	CSM3	Q04659	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	RDS1	P25611	832 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	MRPS5	P33759	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	YFR018C	P43599	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	APC5	Q08683	685 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	GLE1	Q12315	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	MKK1	P32490	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	NAT4	Q04751	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR139W	YGR139W	TAE1	P38340	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	BDH1	P39714	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	SPO73	P40031	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	COS4	P43542	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	YHC3	P47040	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	NRM1	P53718	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	DIA1	P54005	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	MXR2	P25566	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	YHR122W	P38829	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RPN14	P53196	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	GMC1	Q04399	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	VPS63	O13549	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	COX10	P21592	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	ERG9	P29704	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	SRB2	P34162	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	SNF2	P22082	1703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	DAL5	P15365	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	YMR134W	P40207	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	YIL059C	P40520	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	FAR10	Q06001	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	TAF10	Q12030	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	YCH1	P42937	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	HIT1	P46973	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RCF1	Q03713	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	RPN6	Q12377	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	FRE6	Q12473	712 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	UTR1	P21373	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YGR139W	YGR139W	CUP2	P15315	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	OPY1	P38271	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	PEX32	P38292	413 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	RAD1	P06777	1100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	YNL143C	P53908	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	SPH1	Q06160	661 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	USO1	P25386	1790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	CPT1	P17898	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	YMR262W	P38430	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	RRG9	P40156	214 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	INP1	Q03694	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	ARR1	Q06596	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
YGR139W	YGR139W	MIC19	P43594	170 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	DCC1	P25559	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	MMS21	P38632	267 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	ECM19	Q06011	112 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	RGS2	Q99188	309 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YGR139W	YGR139W	SAG1	P20840	650 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YGR139W	YGR139W	IML3	P38265	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YGR139W	YGR139W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YGR139W	YGR139W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YGR139W	YGR139W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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