RNA–Protein interactions for RNA: YGL180W

ATG1, Transcript of Protein serine/threonine kinase, yeast

Gene ATG1, Length 2,694 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG1	YGL180W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YHR035W	P38769	630 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SUR2	P38992	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	MST28	P39552	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	HAT2	P39984	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YPT11	P48559	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	BSP1	Q06604	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	HTB2	P02294	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	AME1	P38313	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	POG1	P40473	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	PMT4	P46971	762 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	IBA57	P47158	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	VEL1	P53058	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SWS2	P53937	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YEH2	Q07950	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	CBS2	P14905	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	EXO70	P19658	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YCR100C	P25606	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	CSE1	P33307	960 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	JLP2	P40206	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SER33	P40510	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	TPN1	P53099	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	VHT1	P53241	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	PHO80	P20052	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	MNS1	P32906	549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	TIR2	P33890	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YKL063C	P35725	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YBP1	P38315	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	MET30	P39014	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	GWT1	P47026	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	MRPL50	P53724	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	CAF40	P53829	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	URA6	P15700	204 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SPO11	P23179	398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	QRI5	P32344	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	LIP5	P32875	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	CHS7	P38843	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	RBG1	P39729	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	TOS8	P53147	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	SPR6	Q01684	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	TAD2	P47058	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	GOR1	P53839	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	VAC7	P53950	1165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	MRS2	Q01926	470 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	BCH1	Q05029	724 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	AIM39	Q08223	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	ARP6	Q12509	438 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG1	YGL180W	UBC8	P28263	218 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	CIN2	P46670	268 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	SUR7	P54003	302 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	SCS7	Q03529	384 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	PNS1	Q12412	539 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	TFS1	P14306	219 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	SNF6	P18888	332 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	HCM1	P25364	564 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	COX13	P32799	129 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	CBP4	P37267	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	HMT1	P38074	348 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	YHK8	P38776	514 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	RTS2	P40962	232 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	YJL043W	P47053	257 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	THI7	Q05998	598 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	DXO1	Q06349	442 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	RPB8	P20436	146 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	SGE1	P33335	543 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	POP7	P38291	140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	BMT5	P40493	336 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	ALG13	P53178	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	JAC1	P53193	184 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	STP1	Q00947	519 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	TIM18	Q08749	192 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	POM152	P39685	1337 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	SRY1	P36007	326 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATG1	YGL180W	YBR056W	P38081	501 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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