RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YGR026W	P53217	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	GIM3	P53900	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	RHO4	Q00246	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	HLR1	Q04429	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	RSF1	Q05043	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	BTS1	Q12051	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TRM13	Q12383	476 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	EAF3	Q12432	401 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FSH3	Q99369	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YCR100C	P25606	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ATS1	P31386	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YEF1	P32622	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ECT1	P33412	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PRE3	P38624	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PHO90	P39535	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	POP1	P41812	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TOS2	P50078	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YGL159W	P53110	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	CDH1	P53197	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YGR042W	P53227	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	VHT1	P53241	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	VPS62	P53285	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	CWC24	P53769	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TGL2	P54857	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SPR28	Q04921	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	KEI1	Q06346	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ANT1	Q06497	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YEH1	Q07804	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SUL2	Q12325	893 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	HAP4	P14064	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YSR3	P23501	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YCL002C	P25565	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	CNE1	P27825	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	LDS1	P31379	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	COQ2	P32378	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SUA5	P32579	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SFK1	P35735	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TAE1	P38340	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	NEO1	P40527	1151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PMT6	P42934	759 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SFH5	P47008	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PHO23	P50947	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	RSM27	P53305	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SPC19	Q03954	165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	BNA7	Q04066	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ROY1	Q04847	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	GAS2	Q06135	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PEX30	Q06169	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	CYK3	Q07533	885 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ATG10	Q07879	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	FDH1	Q08911	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	GUP2	Q08929	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PHO2	P07269	559 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	REV1	P12689	985 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	CBS1	P14066	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ZRC1	P20107	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	RPB5	P20434	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ADE1	P27616	306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YJU3	P28321	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	YMC1	P32331	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	ISF1	P32488	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	SFA1	P32771	386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	PPG1	P32838	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL28	YGL103W	MDL1	P33310	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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