RNA–Protein interactions for RNA: YDR057W

YOS9, Transcript of ER quality-control lectin, yeast

Gene YOS9, Length 1,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOS9	YDR057W	SHO1	P40073	367 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	RRG9	P40156	214 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	TPN1	P53099	579 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	YIP5	P53108	310 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	SWC4	P53201	476 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	YNL184C	P53876	108 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	SIZ1	Q04195	904 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	YML096W	Q04489	525 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	MRPL35	Q06678	367 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	SCP1	Q08873	200 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	AFT2	Q08957	416 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	YOR012W	Q12351	137 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	RRI1	Q12468	440 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	IRC20	Q06554	1556 aa		6.28	□□□□□ -1.4
YOS9	YDR057W	LYS2	P07702	1392 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	NUP170	P38181	1502 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	HEM15	P16622	393 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	NUP1	P20676	1076 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ARG1	P22768	420 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	GPI12	P23797	304 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	VMA3	P25515	160 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	OCH1	P31755	480 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YPT53	P36019	220 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MRPL3	P36516	390 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MAF1	P41910	395 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YCH1	P42937	148 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SPT20	P50875	604 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	DOC1	P53068	250 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YNR071C	P53757	342 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	APS2	Q00381	147 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YMR160W	Q03823	816 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RKM2	Q03942	479 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	HRD3	Q05787	833 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	FEX1	Q08913	375 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	VPS15	P22219	1454 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TY1B-H	O13535	1793 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ERG8	P24521	451 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YKL162C	P36052	402 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	GLC8	P41818	229 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SLS1	P42900	643 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SPG5	P42933	373 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ERG5	P54781	538 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YCL001W-A	P87012	153 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	CYK3	Q07533	885 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	CRD1	Q07560	283 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RDI1	Q12434	202 aa		6.26	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YCR023C	P25351	611 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	CPR3	P25719	182 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PPZ1	P26570	692 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SCM4	P32564	187 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YEF1	P32622	495 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	TRM2	P33753	639 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ARA1	P38115	344 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	HXT16	P47185	567 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	AIF1	P52923	378 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YML037C	Q03703	340 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ASR1	Q06834	288 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ENV7	Q12003	364 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	NUS1	Q12063	375 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RRD2	Q12461	358 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	GAL80	P04387	435 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PHO2	P07269	559 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	IMA3	P0CW40	589 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	IMA4	P0CW41	589 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	STF2	P16965	84 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SCD5	P34758	872 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SAF1	P38352	637 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	VHS2	P40463	436 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	GSM1	P42950	618 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	IKS1	P47042	667 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	FLC3	P53121	802 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	PRM6	Q04705	352 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	IMA2	Q08295	589 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	OSW1	Q08692	278 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	YPR063C	Q12160	140 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YOS9	YDR057W	RMD5	Q12508	421 aa		6.25	□□□□□ -1.41

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