RNA–Protein interactions for RNA: HRA1

HRA1, Non-protein-coding RNA, yeast

Gene HRA1, Length 564 nt, Biotype ncRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRA1	HRA1	YMR010W	Q03687	405 aa		7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	EKI1	Q03764	534 aa		7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	MRPL1	Q04599	285 aa		7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	COX20	Q04935	205 aa		7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	GPI11	Q06636	219 aa		7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YLR040C	Q07988	224 aa		7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YDL180W	Q12301	547 aa		7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	MHF2	Q3E829	80 aa		7	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RAD7	P06779	565 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	SEN2	P16658	377 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	SEC2	P17065	759 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	DBF2	P22204	572 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	UBC8	P28263	218 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	ATG14	P38270	344 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	GAB1	P41733	394 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RNH1	Q04740	348 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	LSO1	Q3E827	93 aa		6.99	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	CAP2	P13517	287 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RIB1	P38066	345 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	SNX4	P47057	423 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	SPR6	Q01684	191 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YOR214C	Q12282	236 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RTR2	Q12378	196 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	NPC2	Q12408	173 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	BPH1	P25356	2167 aa		6.98	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	CCW14	O13547	238 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	ARG3	P05150	338 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	MRPL17	P36528	281 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	NAT2	P37293	288 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YBR220C	P38318	560 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	MTC6	P38849	526 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YHR219W	P38900	624 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YAR028W	P39548	234 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	NTA1	P40354	457 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YIL165C	P40446	119 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	RRN5	Q02983	363 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	COA4	Q05809	96 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	COQ11	Q05892	277 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YPQ2	Q06328	317 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	YOL131W	Q08270	108 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	ENB1	Q08299	606 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	MCP1	Q12106	302 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	ATP16	Q12165	160 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HRA1	HRA1	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ITR1	P30605	584 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	HIR2	P32480	875 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	GPX2	P38143	162 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	YHL044W	P38727	235 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	PCP1	P53259	346 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	DAM1	P53267	343 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ISU1	Q03020	165 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	MFG1	Q07684	458 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	THP1	Q08231	455 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	GRE1	Q08969	168 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	DYN1	P36022	4092 aa		6.96	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	MOD5	P07884	428 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ENA1	P13587	1091 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	SPT14	P32363	452 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	CHK1	P38147	527 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	YHR180W	P38868	163 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	SWD1	P39706	426 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	COG3	P40094	801 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	SLS1	P42900	643 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	MRPL19	P53875	158 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ENA2	Q01896	1091 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	YDR514C	Q04408	483 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	RPN6	Q12377	434 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ENA5	Q12691	1091 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	YAL064W-B	O13512	126 aa		6.94	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	ARG81	P05085	880 aa		6.94	□□□□□ -1.3
HRA1	HRA1	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11 ms