RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC43Q8N309 656 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF558Q96NG5 402 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO10Q9HD67 2058 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf71A6NGG8 1288 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD18B2RXH4 712 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.97■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 PRR16Q569H4 304 aa26.96■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 RIPOR3Q96MK2 946 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.96■■□□□ 1.91
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CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0U1RQF3 1178 aa26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 C2CD4DB7Z1M9 353 aa26.94■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC10P48553 1259 aa26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 KRT17Q04695 432 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 DISC1Q9NRI5 854 aa26.92■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 WDR64B1ANS9 1081 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.91■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.91■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 SNX27Q96L92 541 aa26.91■■□□□ 1.9
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMOD1P28289 359 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 BCAR1P56945 870 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 ITIH3Q06033 890 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 KANK3Q6NY19 840 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 GJA10Q969M2 543 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBP1Q9H171 429 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 DCHS1Q96JQ0 3298 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQ27 194 aa26.89■■□□□ 1.9
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