RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	CASD1	Q96PB1	797 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	DMD	P11532	3685 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASAP2	O43150	1006 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	EOMES	O95936	686 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	DNAJB1	P25685	340 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	LPP	Q93052	612 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	CWH43	Q9H720	699 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEDD4L-233	ENST00000591989	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MED24	O75448	989 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	DGAT1	O75907	488 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	FGF18	O76093	207 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LYPLA2	O95372	231 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LAG3	P18627	525 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	GJB2	P29033	226 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	IRS1	P35568	1242 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PHKA2	P46019	1235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CAMK1	Q14012	370 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC43	Q8N309	656 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ERMN	Q8TAM6	284 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989		H3BQV1	296 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SKI	P12755	728 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21	5e-25	■■■□□ 18.9
NEDD4L-233	ENST00000591989	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MCM2	P49736	904 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	RARRES1	P49788	294 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	HYAL1	Q12794	435 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TFDP1	Q14186	410 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NACC1	Q96RE7	527 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NCK2	O43639	380 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ERLIN2	O94905	339 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PBX3	P40426	434 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTGDR	Q13258	359 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLUL1	Q15846	466 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF558	Q96NG5	402 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	LINC01565	O15544	149 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLRA2	P23416	452 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPA1	P27694	616 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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