RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 TRIM13O60858 407 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 EPHB1P54762 984 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KSR1Q8IVT5 923 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CLEC4FQ8N1N0 589 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 SHROOM2Q13796 1616 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 FANCAO15360 1455 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 BIRC5O15392 142 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ANXA1P04083 346 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 TALDO1P37837 337 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ZFP42Q96MM3 310 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 SPAG6O75602 509 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KLHL2O95198 593 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KRT6BP04259 564 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KRT6CP48668 564 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 NCF4Q15080 339 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 NSMFQ6X4W1 530 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CDH24Q86UP0 819 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 COX16Q9P0S2 106 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 C5orf58C9J3I9 102 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 TOM1O60784 492 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CDH16O75309 829 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 GFPT2O94808 682 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 MDH1P40925 334 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ROR1Q01973 937 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CPXCR1Q8N123 301 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 BTN2A2Q8WVV5 523 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 GCNAQ96QF7 691 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CDY2AQ9Y6F7 541 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CD109Q6YHK3 1445 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 MYO5CQ9NQX4 1742 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 POTEFA5A3E0 1075 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KLRF2D3W0D1 207 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 GPS1Q13098 491 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 TTC23LQ6PF05 361 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ACAP3Q96P50 834 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 HACD3Q9P035 362 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 FAM47DPA6NHR8 397 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CCND2P30279 289 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 PTPROQ16827 1216 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 FAM45AQ8TCE6 357 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 FAR2Q96K12 515 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 PIGUQ9H490 435 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CFAP69A5D8W1 941 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.556e-7■■■■□ 19.3
SMG1-211ENST00000565324 KRT6AP02538 564 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 SRLQ86TD4 932 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CROCCP3Q8IVE0 287 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 BTBD18B2RXH4 712 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 DLGAP3O95886 979 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 IL2RBP14784 551 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CCNE1P24864 410 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 POLD1P28340 1107 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 TAB1Q15750 504 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ERICH1Q86X53 443 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 FAM9CQ8IZT9 166 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 OSBPL10Q9BXB5 764 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 AMNQ9BXJ7 453 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 RCOR1Q9UKL0 485 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 TBKBP1A7MCY6 615 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 CFAP99D6REC4 459 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 STX7O15400 261 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ZNF790Q6PG37 636 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 ARHGEF10O15013 1369 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 FAM25AB3EWG3 89 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 FAM25CB3EWG5 89 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 FAM25GB3EWG6 89 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 RNF103O00237 685 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 KIF22Q14807 665 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 UGP2Q16851 508 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 MTERF3Q96E29 417 aa5.39□□□□□ -1.55
SMG1-211ENST00000565324 IFT43Q96FT9 208 aa5.39□□□□□ -1.55
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