RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561407.1

TMOD2-206, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-206ENST00000561407 CD83Q01151 205 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 DSG1Q02413 1049 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 POU5F1BQ06416 359 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 KANK2Q63ZY3 851 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 TMTC2Q8N394 836 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CPA6Q8N4T0 437 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 KIAA1958Q8N8K9 716 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 SMC1BQ8NDV3 1235 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 USP7Q93009 1102 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PTPN18Q99952 460 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 MENTQ9BUN1 341 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ANO9A1A5B4 782 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 A6NNZ2 444 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 H7C1D1 291 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 LAMTOR5O43504 91 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PCDHGA12O60330 932 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PIP5K1CO60331 668 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 TCEA3O75764 348 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 MYBL2P10244 700 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 TRAPPC10P48553 1259 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 SURF1Q15526 300 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF174Q15697 407 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF827Q17R98 1081 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 TMEM240Q5SV17 173 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 KIF18BQ86Y91 864 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 RUNDC1Q96C34 613 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 C16orf92Q96LL3 132 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 OR10A5Q9H207 317 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ACSS2Q9NR19 701 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 OXSMQ9NWU1 459 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.7□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CUX2O14529 1486 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CUTAO60888 179 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CYP17A1P05093 508 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 SRGNP10124 158 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 KCNQ1P51787 676 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 EPHB4P54760 987 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 MOGSQ13724 837 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 LOXL4Q96JB6 756 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PCIF1Q9H4Z3 704 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 LUZP4Q9P127 313 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 FAM50BQ9Y247 325 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 SPO11Q9Y5K1 396 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.69□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 A0A0G2JNJ9 132 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 FKBP9O95302 570 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 PRLP01236 227 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 FAM163BP0C2L3 166 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 ETV4P43268 484 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD2-206ENST00000561407 RGS3P49796 1198 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms