RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 STXBP2Q15833 593 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SPECC1Q5M775 1068 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GJA10Q969M2 543 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GPRASP2Q96D09 838 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 EPSTI1Q96J88 318 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 AK8Q96MA6 479 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.89□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 HTTP42858 3142 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 A0A087X0B3 334 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ASB14A6NK59 587 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ATP9AO75110 1047 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TRPA1O75762 1119 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF202O95125 648 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 PFKFB1P16118 471 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 KCNA2P16389 499 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CDC25AP30304 524 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SOX18P35713 384 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TECP42680 631 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 NDUFA8P51970 172 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CAP1Q01518 475 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 PPP2R5CQ13362 524 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MTMR1Q13613 665 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 DPP9Q86TI2 863 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 NLRX1Q86UT6 975 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GPR152Q8TDT2 470 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MAML3Q96JK9 1138 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 NACC1Q96RE7 527 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 UIMC1Q96RL1 719 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 RIT2Q99578 217 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 KATNBL1Q9H079 304 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 VAV3Q9UKW4 847 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 NFASCO94856 1347 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 PP2D1A8MPX8 630 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SLC26A4O43511 780 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MARCH6O60337 910 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TGFB3P10600 412 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SCNN1AP37088 669 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SYKP43405 635 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 PSMC4P43686 418 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GATA4P43694 442 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 FCGRTP55899 365 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SP3Q02447 781 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GRIK4Q16099 956 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 GNPTABQ3T906 1256 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 HYIQ5T013 277 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ARMCX2Q7L311 632 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CABP7Q86V35 215 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 HELQQ8TDG4 1101 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 CDHR1Q96JP9 859 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TIGD1Q96MW7 591 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TINF2Q9BSI4 451 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 RAB34Q9BZG1 259 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 DACT1Q9NYF0 836 aa6.87□□□□□ -1.31
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms