RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 BRD1O95696 1058 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 STAG3L1P0CL83 205 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 IGFBP4P22692 258 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 SLC12A3P55017 1021 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 MCM6Q14566 821 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 LPPQ93052 612 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.72■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.71■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 TSPAN1O60635 241 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTX4-203ENST00000447419 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTX4-203ENST00000447419 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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PTX4-203ENST00000447419 COL6A3P12111 3177 aa22.7■■□□□ 1.22
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PTX4-203ENST00000447419 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-203ENST00000447419 CSPG5O95196 566 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-203ENST00000447419 SLC34A2O95436 690 aa22.7■■□□□ 1.22
PTX4-203ENST00000447419 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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PTX4-203ENST00000447419 DEPTORQ8TB45 409 aa22.7■■□□□ 1.22
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PTX4-203ENST00000447419 ARSHQ5FYA8 562 aa22.69■■□□□ 1.22
PTX4-203ENST00000447419 GPBP1Q86WP2 473 aa22.69■■□□□ 1.22
PTX4-203ENST00000447419 PDILTQ8N807 584 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTX4-203ENST00000447419 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.69■■□□□ 1.22
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PTX4-203ENST00000447419 RAD54LQ92698 747 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTX4-203ENST00000447419 ERVK-21P61565 698 aa22.67■■□□□ 1.22
PTX4-203ENST00000447419 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTX4-203ENST00000447419 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PTX4-203ENST00000447419 LINC00271P0C7V0 271 aa22.65■■□□□ 1.22
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PTX4-203ENST00000447419 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTX4-203ENST00000447419 PPP2R5AQ15172 486 aa22.65■■□□□ 1.22
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