RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CMR3	YPR013C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CMR3	YPR013C	DDC1	Q08949	612 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CMR3	YPR013C	FCY22	Q12119	530 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CMR3	YPR013C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CMR3	YPR013C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.84	□□□□□ -1.79
CMR3	YPR013C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
CMR3	YPR013C	TRP1	P00912	224 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RRT12	P25381	491 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	SRB4	P32569	687 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CYM1	P32898	989 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	PRM5	P40476	318 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CIN2	P46670	268 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	SCS3	P53012	380 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CGR1	P53188	120 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MTQ1	P53944	314 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ESA1	Q08649	445 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	HNT3	Q08702	217 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPN6	Q12377	434 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ATG31	Q12421	196 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CHD1	P32657	1468 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	HEM4	P06174	275 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	FUN26	P31381	517 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	KRE6	P32486	720 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YKL063C	P35725	167 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MSS2	P40990	351 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	PMT4	P46971	762 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MTM1	P53320	366 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	PGA2	P53903	129 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	TRM82	Q03774	444 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	SNX41	Q04053	625 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	PAM18	Q07914	168 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.82	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	REP1	P03871	373 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	PRB1	P09232	635 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CTA1	P15202	515 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CPR4	P25334	318 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ZIP1	P31111	875 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	NUP2	P32499	720 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.81	□□□□□ -1.8	not detected
CMR3	YPR013C	SDH3	P33421	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPC37	P36121	282 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	BIG1	P38813	335 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	COA1	P40452	197 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	IDP2	P41939	412 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	OTU1	P43558	301 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MRPL50	P53724	139 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	TMS1	Q12116	473 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	POM33	Q12164	279 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	FRE8	Q12209	686 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	SAL1	D6W196	494 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	NAM2	P11325	894 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RCK2	P38623	610 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MST27	P53176	234 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	SWC4	P53201	476 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CPD1	P53314	239 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YML122C	Q03207	126 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	SLM3	Q12093	417 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	HMS1	Q12398	434 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ARG80	P07249	177 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MSI1	P13712	422 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	MCH2	P36032	473 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YIL067C	P40514	678 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	YIA6	P40556	373 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	CLD1	P53264	445 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	GTO3	Q04806	366 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	GRS2	Q06817	618 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	ERD1	P16151	362 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CMR3	YPR013C	RPB5	P20434	215 aa		3.78	□□□□□ -1.8

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