RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	RCK2	P38623	610 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ARP1	P38696	384 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	DDI1	P40087	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	COS4	P43542	379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TIS11	P47977	285 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YET3	Q07451	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SFM1	Q12314	213 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YCR102C	P25608	368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	UBC8	P28263	218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	GDA1	P32621	518 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SKN1	P33336	771 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	KAE1	P36132	386 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	FLO10	P36170	1169 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	PHO90	P39535	881 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SHO1	P40073	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TAD2	P47058	250 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YGR035C	P53222	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	GOR1	P53839	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MSS11	Q03825	758 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	CSM3	Q04659	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ENB1	Q08299	606 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	APC9	Q12107	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SET6	Q12529	373 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	REV3	P14284	1504 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
HOF1	YMR032W	KIN3	P22209	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MBR1	P23493	339 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	VPH2	P32341	215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	VAM7	P32912	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YKL187C	P34231	750 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ECM15	P35195	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	CIN2	P46670	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TRS85	P46944	698 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YJR079W	P47126	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RIM8	P53179	542 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	USV1	Q12132	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	JLP1	Q12358	412 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	PET54	P10834	293 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ATO2	P32907	282 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	LST4	P34239	828 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	COG3	P40094	801 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YFL040W	P43562	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YJR054W	P47114	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ALG13	P53178	202 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	NMA2	P53204	395 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YGR151C	P53287	111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RMI1	Q02685	241 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TRM82	Q03774	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	HRD3	Q05787	833 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RKI1	Q12189	258 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
HOF1	YMR032W	UPS2	P35200	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	DRE2	P36152	348 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YAT2	P40017	923 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ASI1	P54074	624 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	KIN4	Q01919	800 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TYR1	P20049	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TOA2	P32774	122 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ECM13	P38195	257 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	MET30	P39014	640 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	BDH1	P39714	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	SHY1	P53266	389 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	NSL1	Q12143	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	RPN6	Q12377	434 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	COS2	P0CX12	379 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	COS3	P0CX13	379 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HOF1	YMR032W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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