RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	HAP2	P06774	265 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	NTH1	P32356	751 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	TFC1	P32367	649 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	DSS4	P32601	143 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	ECT1	P33412	323 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	EMC3	P36039	253 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	BAP3	P41815	604 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MOG1	P47123	218 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YNL165W	P53891	406 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	ASI2	P53895	289 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YDR344C	Q05510	147 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	SOD2	P00447	233 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	CDC21	P06785	304 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	TYR1	P20049	452 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	DCC1	P25559	380 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.44	□□□□□ -1.54	not detected
GPT2	YKR067W	RML2	P32611	393 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	PTM1	P32857	523 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	TIP20	P33891	701 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	ALP1	P38971	573 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	SRP14	P38985	146 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	SBH2	P52871	88 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YGL235W	P53071	178 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	COG1	P53079	417 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YNL260C	P53846	198 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	INN1	P53901	409 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	NUP100	Q02629	959 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	PIR3	Q03180	325 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	VTA1	Q06263	330 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YLR149C	Q99296	730 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	ADH7	P25377	361 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	FUB1	P25659	250 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	PDR3	P33200	976 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	REC104	P33323	182 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	CMC1	P36064	111 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	BUR6	P40096	142 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YFR057W	P43625	151 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YHC3	P47040	408 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	GET1	P53192	235 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	NMA2	P53204	395 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YNR071C	P53757	342 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	SNO1	Q03144	224 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	GAS3	Q03655	524 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	NSE1	Q07913	336 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MLH3	Q12083	715 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YOR012W	Q12351	137 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YLR422W	Q06409	1932 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	HTB2	P02294	131 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YCR099C	P25657	155 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MET22	P32179	357 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MRP21	P38175	177 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MIC12	P38341	106 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	OPT1	P40897	799 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	STD1	Q02794	444 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	NHP10	Q03435	203 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YOR387C	Q08910	206 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	ENV7	Q12003	364 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	PET54	P10834	293 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	MRP13	P12686	339 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	AEP1	P32493	518 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	COS9	P36034	407 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	PRE3	P38624	215 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	COA1	P40452	197 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	IME4	P41833	600 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	SFH5	P47008	294 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	UFD1	P53044	361 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	YLR460C	P54007	376 aa		5.43	□□□□□ -1.54
GPT2	YKR067W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms