RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	MOB2	P43563	287 aa		2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SHE10	P53075	577 aa		2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SDT1	P53078	280 aa		2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	RPN14	P53196	417 aa		2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	BIO4	P53630	237 aa		2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SCS7	Q03529	384 aa		2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	GAS2	Q06135	555 aa		2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	REP1	P03871	373 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	STE7	P06784	515 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SPR1	P32603	445 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	DSE1	P40077	573 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YJR054W	P47114	497 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	GTO1	P48239	356 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	HCH1	P53834	153 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SLT2	Q00772	484 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	FAR10	Q06001	478 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	LIP2	Q06005	328 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YLR177W	Q06251	628 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	MHR1	Q06630	226 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YLR012C	Q07927	99 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YOR376W	Q08900	122 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	LDB17	Q12342	491 aa		2.57	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	CMK2	P22517	447 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	MEI5	P32489	222 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SHE1	P38200	338 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YHR035W	P38769	630 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	PEX18	P38855	283 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	CHL4	P38907	458 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	FHL1	P39521	936 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	PMT4	P46971	762 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	COX16	P47081	118 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	MND1	P53102	219 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	CDH1	P53197	566 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YGR015C	P53208	328 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	VHT1	P53241	593 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YLR152C	P54072	576 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YPL080C	Q02826	108 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	IRC4	Q03036	179 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	ADD37	Q03233	198 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	BCP1	Q06338	283 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SIA1	Q12212	622 aa		2.56	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SPS100	P13130	326 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	GPI12	P23797	304 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	ECT1	P33412	323 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	COS9	P36034	407 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SOL2	P37262	315 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	PEX22	P39718	180 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SLM1	P40485	686 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	IGD1	P43598	195 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	PGU1	P47180	361 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	BIO3	P50277	480 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YNL260C	P53846	198 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.55	□□□□□ -2	not detected
VMA10	YHR039C-A	PRM4	Q12498	284 aa		2.55	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	STE2	D6VTK4	431 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	RAD7	P06779	565 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	CTA1	P15202	515 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	URA10	P30402	227 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	ZRT1	P32804	376 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	PDC2	P32896	925 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YMR262W	P38430	313 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	RCK1	P38622	512 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	WSC4	P38739	605 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	TPC1	P53257	314 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YPQ1	Q12010	308 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	APC9	Q12107	265 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	FMP16	Q12497	93 aa		2.54	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	COX4	P04037	155 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YBR241C	P38142	488 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	GPI18	P38211	433 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	BMT2	P38278	337 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	CTM1	P38818	585 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	TIS11	P47977	285 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	RNH201	P53942	307 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YNL050C	P53952	270 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	RMI1	Q02685	241 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	SNX41	Q04053	625 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	TSA2	Q04120	196 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	YDR115W	Q04598	105 aa		2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2
VMA10	YHR039C-A	ATP6	P00854	259 aa		2.52	□□□□□ -2.01
VMA10	YHR039C-A	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01
VMA10	YHR039C-A	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	2.52	□□□□□ -2.01

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