RNA–Protein interactions for RNA: YGR296W

YRF1-3, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-3, Length 5,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3YGR296W PPA2P28239 310 aa7.46□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SHG1P38337 142 aa7.46□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W STB5P38699 743 aa7.46□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YGR210CP42942 411 aa7.46□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W UFD1P53044 361 aa7.46□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W MRX8Q05473 314 aa7.46□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YPS7Q06325 596 aa7.46□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W ARF1P11076 181 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PHO80P20052 293 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W DTR1P38125 572 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YLR345WQ06137 509 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W MMT2Q08970 484 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SOL2P37262 315 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W XPT1P47165 209 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W RNH1Q04740 348 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W ARV1Q06541 321 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SHE1P38200 338 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PCL6P40038 420 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W NTA1P40354 457 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W HXT16P47185 567 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W RDS2P19541 446 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W ERG3P32353 365 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YEL073CP39974 107 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YGR042WP53227 271 aa7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W FLP1P03870 423 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W TFS1P14306 219 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W BIO2P32451 375 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W WBP1P33767 430 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PHO11P35842 467 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PHO12P38693 467 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W AIM10P39965 576 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YCT1Q12235 531 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PBS2P08018 668 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PRB1P09232 635 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W TMN2Q04562 672 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YLR413WQ06689 675 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SNF5P18480 905 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W HNM1P19807 563 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SNG1P46950 547 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W MMP1Q12372 583 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PHO3P24031 467 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PDC2P32896 925 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YBR139WP38109 508 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W OSH7P38755 437 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W AGP3P43548 558 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W MNN5P46982 586 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YML018CQ03730 393 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PER33Q12144 273 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W HMS1Q12398 434 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PNS1Q12412 539 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W FSH3Q99369 266 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W Q0182Q9ZZW1 134 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W STE50P25344 346 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W MRPL6P32904 214 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W LHP1P33399 275 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YKL077WP36081 392 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W ASK10P48361 1146 aa7.44□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SRB6P32570 121 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SUA5P32579 426 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W DAM1P53267 343 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W LSM7P53905 115 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W ELC1Q03071 99 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SUI1P32911 108 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YHR177WP38867 453 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SYG1P40528 902 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W MTQ1P53944 314 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W TRI1Q05024 226 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W MSB2P32334 1306 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SCO2P38072 301 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YIL077CP40508 320 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W RAD17P48581 401 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W EOS1P53938 366 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YLR460CP54007 376 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YML053CQ04978 212 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W RTT103Q05543 409 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PIB1Q06651 286 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W IRC19Q07843 230 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YOL073CQ08232 322 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W PHO84P25297 587 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W CTS1P29029 562 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SIT1P39980 628 aa7.43□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YOL163WP0CF20 169 aa7.42□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W EXG1P23776 448 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W FRE2P36033 711 aa7.42□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W SSH1P38353 490 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W YER184CP39961 794 aa7.42□□□□□ -1.22
YRF1-3YGR296W FCY21P40039 528 aa7.42□□□□□ -1.22
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