RNA–Protein interactions for RNA: YDR346C

SVF1, Transcript of Protein with a potential role in cell survival pathways, yeast

Gene SVF1, Length 1,446 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVF1	YDR346C	COY1	P34237	679 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	DOA1	P36037	715 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	ECM4	P36156	370 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	MRPL4	P36517	319 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	YMR134W	P40207	237 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	AIM24	P47127	394 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	TIS11	P47977	285 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	SHE10	P53075	577 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	RTT102	P53330	157 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	CUR1	Q06469	252 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	YOP1	Q12402	180 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SVF1	YDR346C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	GPX2	P38143	162 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	FMP33	P46998	180 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	RRN9	P53437	365 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	TIM8	P57744	87 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	IPK1	Q06667	281 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	FRE6	Q12473	712 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.38	□□□□□ -1.71	not detected
SVF1	YDR346C	CBF1	P17106	351 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	WSS1	P38838	269 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	HAC1	P41546	238 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MIG2	P53035	382 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.38	□□□□□ -1.71	not detected
SVF1	YDR346C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	IES3	Q12345	250 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	EGT2	P42835	1041 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	BIR1	P47134	954 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	FMN1	Q03778	218 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	LDS2	Q08218	356 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	VIK1	Q12045	647 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	FLO11	P08640	1367 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MYO1	P08964	1928 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	AST1	P35183	429 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MIG3	P39943	394 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	AIM20	P40451	204 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MAM33	P40513	266 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YFR057W	P43625	151 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	USE1	P53146	245 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MST27	P53176	234 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YLR152C	P54072	576 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	ADD37	Q03233	198 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	LOT6	Q07923	191 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YAK1	P14680	807 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MGT1	P26188	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	TOA2	P32774	122 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YKR015C	P36111	568 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	GEP4	P38812	185 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	FRT2	P39734	528 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	ABM1	P47146	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	BNS1	P50084	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	SHY1	P53266	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	CRH1	P53301	507 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	PRM6	Q04705	352 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	BCP1	Q06338	283 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	SUE1	Q06524	206 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	AAD15	Q08361	143 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	GET4	Q12125	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	MSH5	Q12175	901 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	JID1	Q12350	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	DAP2	P18962	818 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	NUF2	P33895	451 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	FES1	P38260	290 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	RTC2	P38279	296 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	SMF2	P38778	549 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	YGR016W	P53209	190 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	OSH6	Q02201	448 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	SRN2	Q99176	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	NUP2	P32499	720 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	SPR1	P32603	445 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	TIR2	P33890	251 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SVF1	YDR346C	ECM8	P38246	354 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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