RNA–Protein interactions for RNA: YDL135C

RDI1, Transcript of Rho GDP dissociation inhibitor, yeast

Gene RDI1, Length 609 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDI1	YDL135C	YHC3	P47040	408 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	MXR2	P25566	168 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	KEG1	P43614	200 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	NAT4	Q04751	285 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	PRR1	P28708	518 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	NUP2	P32499	720 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	MRPS5	P33759	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	SRB2	P34162	210 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	GAB1	P41733	394 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	SDT1	P53078	280 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	LST7	P53237	242 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	SHY1	P53266	389 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	YET2	Q04210	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	UBX2	Q04228	584 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	MCT1	Q12283	360 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDI1	YDL135C	REV1	P12689	985 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	UTR1	P21373	530 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	SUR1	P33300	382 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YHR182W	P38870	785 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	HEM14	P40012	539 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YGL114W	P53134	725 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	ARP5	P53946	755 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	MHR1	Q06630	226 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	APC5	Q08683	685 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	LDB16	P25587	256 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	IST2	P38250	946 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YER186C	P40101	306 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	OSW5	P40219	148 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YJR030C	P47101	745 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YNL146W	P53906	100 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	MGR3	Q04472	501 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	STE23	Q06010	1027 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	MYO1	P08964	1928 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	ECM29	P38737	1868 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	HEM4	P06174	275 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	RAD1	P06777	1100 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	GAL3	P13045	520 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	CIN8	P27895	1000 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	MKK1	P32490	508 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	RBG1	P39729	369 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YMR134W	P40207	237 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	TIS11	P47977	285 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YLR152C	P54072	576 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	VPS20	Q04272	221 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	LIP2	Q06005	328 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	TOM1	Q03280	3268 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	CDC50	P25656	391 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	IML3	P38265	245 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	OM14	P38325	134 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	PFS1	P38872	237 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	TIM17	P39515	158 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	PES4	P39684	611 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YCH1	P42937	148 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	CSM3	Q04659	317 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	MSC3	Q05812	728 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	VPS63	O13549	108 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	GIT1	P25346	518 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	SPR1	P32603	445 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	MYO3	P36006	1272 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YKR015C	P36111	568 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	PEX32	P38292	413 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	SDS24	P38314	527 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	AIM20	P40451	204 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	NAS6	P50086	228 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	ATP16	Q12165	160 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	UBA3	Q99344	299 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDI1	YDL135C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.5 ms