RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W SPO24Q3E752 67 aa2.42□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W RNR2P09938 399 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W CTA1P15202 515 aa2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W ITR2P30606 609 aa2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W VMA5P31412 392 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W YFR018CP43599 363 aa2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W MRX8Q05473 314 aa2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W YDR286CQ05530 114 aa2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W TAF10Q12030 206 aa2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W RPN6Q12377 434 aa2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W YOL085CQ99345 113 aa2.41□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W MHP1P43638 1398 aa2.4□□□□□ -2.02
NSE4YDL105W VMA2P16140 517 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W TIP20P33891 701 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W TAE1P38340 232 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W FHL1P39521 936 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W TAF6P53040 516 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SCS7Q03529 384 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W BUR2Q05949 395 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YOL029CQ08187 201 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W PGC1Q08959 321 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YDR262WQ12331 272 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa2.4□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W AUS1Q08409 1394 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W VPS63O13549 108 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W CKA2P19454 339 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W ACB1P31787 87 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W MEI5P32489 222 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W FMT1P32785 401 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W FRT2P39734 528 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W NAS2P40555 220 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SHE4P51534 789 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W FAR10Q06001 478 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SPH1Q06160 661 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W BI3Q9ZZW7 517 aa2.39□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W FUS3P16892 353 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W DBP7P36120 742 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YIR035CP40579 254 aa2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W UFE1P41834 346 aa2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W IGO1P53897 168 aa2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W APC4Q04601 652 aa2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W FLO11P08640 1367 aa2.37□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W GAL3P13045 520 aa2.37□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SRB2P34162 210 aa2.37□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W TRR2P38816 342 aa2.37□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YGR168CP53293 376 aa2.37□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W HST4P53688 370 aa2.37□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W PRM7Q12459 698 aa2.37□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W REP1P03871 373 aa2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W TPM1P17536 199 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.36□□□□□ -2.03not detected
NSE4YDL105W SMF2P38778 549 aa2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W INP1Q03694 420 aa2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YDR018CQ12185 396 aa2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W PRM4Q12498 284 aa2.36□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W CDC37P06101 506 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W FRM2P37261 193 aa2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W UTP25P40498 721 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W INP2Q03824 705 aa2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W MGR3Q04472 501 aa2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YPS3Q12303 508 aa2.35□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SAL1D6W196 494 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W STF1P01098 86 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YKL187CP34231 750 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W CTM1P38818 585 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W END3P39013 349 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YIL054WP40524 105 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W MIC19P43594 170 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SDS23P53172 527 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W FMP48P53233 369 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W TPC1P53257 314 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W IRC4Q03036 179 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W GMC1Q04399 608 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W YDL211CQ12121 372 aa2.34□□□□□ -2.03
NSE4YDL105W SPS100P13130 326 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W ERD1P16151 362 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YPS1P32329 569 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W CYM1P32898 989 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W ZRT3P34240 503 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W BDH1P39714 382 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W PMT4P46971 762 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YMR244WQ04018 355 aa2.33□□□□□ -2.04
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