RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	PGS1	P25578	521 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SNC1	P31109	117 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SHP1	P34223	423 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	AGP2	P38090	596 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SBE22	P38814	852 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SSO2	P39926	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
POP4	YBR257W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GAB1	P41733	394 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	BOL2	P53082	120 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	HXT11	P54862	567 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PRM15	Q03262	622 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	TRS31	Q03337	283 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	NHP10	Q03435	203 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	BUR2	Q05949	395 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.2	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SPT3	P06844	337 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SPS2	P08459	502 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	APE1	P14904	514 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YCR102C	P25608	368 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ERG9	P29704	444 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	MSN2	P33748	704 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	VPS51	P36116	164 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PRM9	P39551	298 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	AFG3	P39925	761 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	LAS21	P40367	830 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GDS1	P41913	522 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GTO1	P48239	356 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	CGR1	P53188	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	INN1	P53901	409 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	KTR6	P54070	446 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PET117	Q02771	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GOT1	Q03554	138 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	VHS1	Q03785	461 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ARV1	Q06541	321 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	FRE3	Q08905	711 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	NUS1	Q12063	375 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SIA1	Q12212	622 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YRM1	Q12340	786 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	MED4	Q12343	284 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	DGK1	Q12382	290 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	MTR10	Q99189	972 aa		4.19	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YCR061W	P25639	631 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GSH1	P32477	678 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YBL010C	P32788	280 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RSM22	P36056	628 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	UIP5	P36137	443 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RRF1	P38771	230 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YEL028W	P39989	153 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RRG9	P40156	214 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GTT1	P40582	234 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ATG18	P43601	500 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PMT4	P46971	762 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	HMS2	P47175	358 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	TOM22	P49334	152 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	JAC1	P53193	184 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	ERV29	P53337	310 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	BNA7	Q04066	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	CIA1	Q05583	330 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	NNT1	Q05874	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	GRX8	Q05926	109 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	AAD4	Q07747	329 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YEH1	Q07804	573 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SFG1	Q12507	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.18	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	COX5A	P00424	153 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	REP2	P03872	296 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	TFS1	P14306	219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SIR1	P21691	654 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	SSH4	P32343	579 aa		4.17	□□□□□ -1.74
POP4	YBR257W	PDR3	P33200	976 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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