RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	SSO2	P39926	295 aa		3.17	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	BUR2	Q05949	395 aa		3.17	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	SAL1	D6W196	494 aa		3.16	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	YPS1	P32329	569 aa		3.16	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	PCH2	P38126	564 aa		3.16	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	VEL1	P53058	206 aa		3.16	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	ECM11	Q04110	302 aa		3.16	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	MMT2	Q08970	484 aa		3.16	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	APC2	Q12440	853 aa		3.16	□□□□□ -1.9
POP8	YBL018C	EPT1	P22140	391 aa		3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YFR018C	P43599	363 aa		3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YGR168C	P53293	376 aa		3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	CAB5	Q03941	241 aa		3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	FAR10	Q06001	478 aa		3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.15	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	PET18	P25362	215 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	URA10	P30402	227 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	SWC5	P38326	303 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	SMF2	P38778	549 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	FHL1	P39521	936 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RRT13	P40042	185 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YFL012W	P43580	148 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	TAF6	P53040	516 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	SED5	Q01590	340 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	API2	Q04413	109 aa		3.14	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YKL071W	P36086	256 aa		3.13	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	DTR1	P38125	572 aa		3.13	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	ECM34	P38728	170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	GGC1	P38988	300 aa		3.13	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	FLC3	P53121	802 aa		3.13	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	CUR1	Q06469	252 aa		3.13	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	CCH1	P50077	2039 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	REP1	P03871	373 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RBK1	P25332	333 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	BUD2	P33314	1104 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	TIP20	P33891	701 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	TPC1	P53257	314 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	HCH1	P53834	153 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.12	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RRF1	P38771	230 aa		3.11	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	FET3	P38993	636 aa		3.11	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YER184C	P39961	794 aa		3.11	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YGR067C	P53243	804 aa		3.11	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	NRM1	P53718	249 aa		3.11	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	ITR2	P30606	609 aa		3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	ACB1	P31787	87 aa		3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YKL162C	P36052	402 aa		3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	EFM1	P38732	585 aa		3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	INA22	P40576	216 aa		3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	IES4	Q08561	116 aa		3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	SPS100	P13130	326 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	MEI5	P32489	222 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
POP8	YBL018C	TAE1	P38340	232 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	RCK1	P38622	512 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	PCL7	P40186	285 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YFL040W	P43562	540 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	COQ5	P49017	307 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	YPR1	Q12458	312 aa		3.09	□□□□□ -1.91
POP8	YBL018C	MHP1	P43638	1398 aa		3.09	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	CTA1	P15202	515 aa		3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	CYM1	P32898	989 aa		3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	MRPL40	P36534	297 aa		3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	PMT4	P46971	762 aa		3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	VAC14	Q06708	880 aa		3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	VOA1	P53262	265 aa		3.07	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	ARP5	P53946	755 aa		3.07	□□□□□ -1.92
POP8	YBL018C	YPL080C	Q02826	108 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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