RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CABP7	Q86V35	215 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RNF149	Q8NC42	400 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RNF169	Q8NCN4	708 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CPB2	Q96IY4	423 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	B4GALT5	O43286	388 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	KRT79	Q5XKE5	535 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RPS6KA5	O75582	802 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CA3	P07451	260 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	GLRA2	P23416	452 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	BMP8B	P34820	402 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	IER5	Q5VY09	327 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RDM1	Q8NG50	284 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	LPP	Q93052	612 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM167A	Q96KS9	214 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	MTR	Q99707	1265 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	HES2	Q9Y543	173 aa		11.24	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SPTLC2	O15270	562 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CXCL10	P02778	98 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	FGFR1	P11362	822 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PBX3	P40426	434 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CAPS	Q13938	189 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SHC4	Q6S5L8	630 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	DYM	Q7RTS9	669 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ADAM2	Q99965	735 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573		M0QZ92	97 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	DNAJB2	P25686	324 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	UBA7	P41226	1012 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ME1	P48163	572 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PAK2	Q13177	524 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PDIA5	Q14554	519 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RSPH3	Q86UC2	560 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	DAW1	Q8N136	415 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	HERVK_113	Q902F9	699 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		11.23	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GVL5	298 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	EPOP	A6NHQ4	379 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ENPP3	O14638	875 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TMOD1	P28289	359 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PRPH	P41219	470 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RBL2	Q08999	1139 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	IKBKE	Q14164	716 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ERMN	Q8TAM6	284 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	NACC1	Q96RE7	527 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	COL1A2	P08123	1366 aa		11.22	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	MAGEB2	O15479	319 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	HIP1R	O75146	1068 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PLA2G4B	P0C869	781 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM26D	Q5JW98	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RASIP1	Q5U651	963 aa		11.21	□□□□□ -0.61

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