RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 COL6A3P12111 3177 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 WDR64B1ANS9 1081 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 F8W031 263 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CAPNS1P04632 268 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 MCM2P49736 904 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 OXCT1P55809 520 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 PTH1RQ03431 593 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 GRB10Q13322 594 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 DOC2BQ14184 412 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 NECTIN1Q15223 517 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CREB3L3Q68CJ9 461 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 FIBCD1Q8N539 461 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 CHST7Q9NS84 486 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GUL6 1792 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 ZMYM6O95789 1325 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-210ENST00000512194 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 SLC27A2O14975 620 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 MYO1BO43795 1136 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 FGAP02671 866 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 FGFR1P11362 822 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 SRFP11831 508 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 BTDP43251 543 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 NT5C2P49902 561 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 TCEA2Q15560 299 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 HSCBQ8IWL3 235 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 TEX11Q8IYF3 940 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 LCORLQ8N3X6 602 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 BRF1Q92994 677 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 AK9Q5TCS8 1911 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 GAKO14976 1311 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 PSMD14O00487 310 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 PRAMEF1O95521 474 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CHGBP05060 677 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD1Q15327 319 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 DLGAP5Q15398 846 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 VPS53Q5VIR6 699 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 DPF2Q92785 391 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CCDC140Q96MF4 163 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 NEK1Q96PY6 1258 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CDC6Q99741 560 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 HDAC8Q9BY41 377 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 IL25Q9H293 177 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 TMX1Q9H3N1 280 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 USP40Q9NVE5 1235 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 H7C1D1 291 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 PROCP04070 461 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 GSNP06396 782 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CLCN7P51798 805 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 NEK4P51957 841 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CFAP100Q494V2 611 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-210ENST00000512194 CERS5Q8N5B7 392 aa8.5□□□□□ -1.05
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