RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.91□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.91□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 STAMQ92783 540 aa7.91□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 UIMC1Q96RL1 719 aa7.91□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 LXNQ9BS40 222 aa7.91□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 TRIM5Q9C035 493 aa7.91□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.91□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 CCNE2O96020 404 aa7.9□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.9□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.9□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 SEPT14Q6ZU15 432 aa7.9□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 ARMCX2Q7L311 632 aa7.9□□□□□ -1.14
SMARCE1-211ENST00000493660 TPH2Q8IWU9 490 aa7.9□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 ANKEF1Q9NU02 776 aa7.9□□□□□ -1.14
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SMARCE1-211ENST00000493660 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 EHHADHQ08426 723 aa7.9□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 STIM1Q13586 685 aa7.9□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 SNX1Q13596 522 aa7.9□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 GSDMDP57764 484 aa7.89□□□□□ -1.15
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SMARCE1-211ENST00000493660 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 BICD1Q96G01 975 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 OPA1O60313 960 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 RGS2P41220 211 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMC6P62333 389 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 SP2Q02086 613 aa7.89□□□□□ -1.15
SMARCE1-211ENST00000493660 TMED1Q13445 227 aa7.89□□□□□ -1.15
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