RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CUTA	O60888	179 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CTNNB1	P35222	781 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	BMPR1A	P36894	532 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPC3	P51654	580 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPM6B	Q13491	265 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ANO5	Q75V66	913 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	SCLT1	Q96NL6	688 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CEP89	Q96ST8	783 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PLVAP	Q9BX97	442 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CSRNP2	Q9H175	543 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTC3	P53804	2025 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A087X0B3	334 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A1W2PQ27	194 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A1W2PQ64	194 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A1W2PQD8	194 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554		C9IYK1	514 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	MGEA5	O60502	916 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	TXK	P42681	527 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ME1	P48163	572 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPT2	Q8TD30	523 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRRC15	Q8TF66	581 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	HLA-C	Q95604	372 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	LXN	Q9BS40	222 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	WDR81	Q562E7	1941 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM150B	A6NC51	233 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	POTEM	A6NI47	508 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	RFC5	P40937	340 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	UBE2H	P62256	183 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM189B	P81408	668 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	DSC3	Q14574	896 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	GSE1	Q14687	1217 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	EPSTI1	Q96J88	318 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CEP170P1	Q96L14	293 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	HOXA2	O43364	376 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	LIG1	P18858	919 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CMA1	P23946	247 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CDC25A	P30304	524 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	TEC	P42680	631 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	NPEPPS	P55786	919 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	DRP2	Q13474	957 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDIA5	Q14554	519 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	P2RX5	Q93086	422 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SCAMP4-208	ENST00000489554	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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