RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487271.5

TRAF3IP3-215, Transcript of TRAF3 interacting protein 3, human

TSL 4

Gene TRAF3IP3, Length 499 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271		K7ENM7	598 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	BIN1	O00499	593 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SLC16A4	O15374	487 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	GCNT3	O95395	438 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	GLRA2	P23416	452 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	HOXC8	P31273	242 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	NAMPT	P43490	491 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	PHKA2	P46019	1235 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	FAAP100	Q0VG06	881 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	STRN3	Q13033	797 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	COASY	Q13057	564 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	PSMD2	Q13200	908 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	GSDMA	Q96QA5	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	HIPK3	Q9H422	1215 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271		A0A087WZ62	844 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271		K7ERI5	159 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	EVI5	O60447	810 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CAND2	O75155	1236 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	KIF20A	O95235	890 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CD4	P01730	458 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CKB	P12277	381 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	RAG1	P15918	1043 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	ABCD1	P33897	745 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	NPTX2	P47972	431 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	GPC3	P51654	580 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	EFNA5	P52803	228 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	STIM1	Q13586	685 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CAPS	Q13938	189 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SNX17	Q15036	470 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	OSMR	Q99650	979 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	ERLIN2	O94905	339 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SELP	P16109	830 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	ZNF131	P52739	623 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CCL23	P55773	120 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	MAPK7	Q13164	816 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	KCNB1	Q14721	858 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	MAPK6	Q16659	721 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	RPAIN	Q86UA6	219 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	DAW1	Q8N136	415 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	WNT8B	Q93098	351 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	BICD1	Q96G01	975 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	KLRC4	O43908	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	GPR32	O75388	356 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	RPS6KA5	O75582	802 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CAPN15	O75808	1086 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SCP2	P22307	547 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	ALCAM	Q13740	583 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TRAF3IP3-215	ENST00000487271	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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