RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CRIPAKQ8N1N5 446 aa27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 ASAP3Q8TDY4 903 aa27.81■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 CDH23Q9H251 3354 aa27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 DGKIO75912 1065 aa27.8■■■□□ 2.04
HTATSF1-202ENST00000425695 MUTP22033 750 aa27.8■■■□□ 2.04
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HTATSF1-202ENST00000425695 FIBCD1Q8N539 461 aa27.8■■■□□ 2.04
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HTATSF1-202ENST00000425695 FAM102BQ5T8I3 360 aa27.78■■■□□ 2.04
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HTATSF1-202ENST00000425695 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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HTATSF1-202ENST00000425695 KCNK18Q7Z418 384 aa27.74■■■□□ 2.03
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HTATSF1-202ENST00000425695 USP28Q96RU2 1077 aa27.71■■■□□ 2.03
HTATSF1-202ENST00000425695 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
HTATSF1-202ENST00000425695 LINC00271P0C7V0 271 aa27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1-202ENST00000425695 BMPR1AP36894 532 aa27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1-202ENST00000425695 MBTD1Q05BQ5 628 aa27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1-202ENST00000425695 POU5F1BQ06416 359 aa27.7■■■□□ 2.02
HTATSF1-202ENST00000425695 GPM6BQ13491 265 aa27.7■■■□□ 2.02
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