RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C TPD3P31383 635 aa3.48□□□□□ -1.85
HAL9YOL089C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data3.48□□□□□ -1.85not detected
HAL9YOL089C UBP2Q01476 1272 aa3.48□□□□□ -1.85
HAL9YOL089C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
HAL9YOL089C MKS1P34072 584 aa3.46□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C YIR007WP40566 764 aa3.46□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C GLY1P37303 387 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C DFG5Q05031 458 aa3.45□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C TCB1Q12466 1186 aa3.45□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C TRK2P28584 889 aa3.45□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C AAD14P42884 376 aa3.45□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C CSN12P47130 423 aa3.45□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C ACO2P39533 789 aa3.44□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C HPF1Q05164 967 aa3.44□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C BDS1Q08347 646 aa3.44□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C MTC5Q03897 1148 aa3.43□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C VAC17P25591 423 aa3.43□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C MRT4P33201 236 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C TY1A-BLQ12266 440 aa3.42□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C RTT106P40161 455 aa3.41□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C YJR098CP47139 656 aa3.41□□□□□ -1.86
HAL9YOL089C TEC1P18412 486 aa3.4□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C YBL086CP38177 466 aa3.4□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C YPR204WQ08995 1032 aa3.4□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C DLD3P39976 496 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C RAD59Q12223 238 aa3.39□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C FIG4P42837 879 aa3.39□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C ROG3P43602 733 aa3.38□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C EMW1P42842 904 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C KTR1P27810 393 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C RPP2BP02400 110 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C DAT1P13483 248 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C OSH7P38755 437 aa3.37□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C LSB3P43603 459 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C GUT2P32191 649 aa3.36□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C NSG2P53898 299 aa3.36□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C SSA2P10592 639 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C ATG20Q07528 640 aa3.35□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C THI72Q08579 599 aa3.35□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C ICP55P40051 511 aa3.34□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C TY1A-MR1Q04215 440 aa3.34□□□□□ -1.87
HAL9YOL089C FBP26P32604 452 aa3.34□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C RSC30P38781 883 aa3.34□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C CEM1P39525 442 aa3.34□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C AIM7Q12156 149 aa3.34□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C MDJ1P35191 511 aa3.33□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C ALA1P40825 983 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C LYS5P50113 272 aa3.33□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C STE20Q03497 939 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C DPH6Q12429 685 aa3.33□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C TBS1P38114 1094 aa3.33□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C SBP1P10080 294 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C AHP1P38013 176 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C YBL036CP38197 257 aa3.31□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C PHM7Q12252 991 aa3.31□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C KIN1P13185 1064 aa3.3□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C AI1P03875 834 aa3.3□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C ISF1P32488 338 aa3.3□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C ISU1Q03020 165 aa3.3□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C ISR1Q06098 443 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C CDC19P00549 500 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C UTR2P32623 467 aa3.29□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C UTP7P40055 554 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C CUZ1P53899 274 aa3.28□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C STE6P12866 1290 aa3.28□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C EMP47P43555 445 aa3.28□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C YNR014WP53719 212 aa3.28□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
HAL9YOL089C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C ADE12P80210 433 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C BRL1P38770 471 aa3.27□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C WTM2Q12206 467 aa3.27□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C CCP1P00431 361 aa3.26□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C JJJ3P47138 172 aa3.25□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C FRA1Q07825 749 aa3.24□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C YPR053CQ6Q5F3 151 aa3.24□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C UBP15P50101 1230 aa3.24□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C NAF1P53919 492 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C YPR084WQ06821 456 aa3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C MCM16Q12262 181 aa3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C GUA1P38625 525 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C SOH1P38633 127 aa3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C ATG3P40344 310 aa3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C YMR187CQ03236 431 aa3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C FPS1P23900 669 aa3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C YDJ1P25491 409 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C DIT1P21623 536 aa3.22□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C DAL1P32375 460 aa3.22□□□□□ -1.89
HAL9YOL089C NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data3.22□□□□□ -1.89not detected
HAL9YOL089C SBE2P42223 864 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C VTC4P47075 721 aa3.21□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C MRX12P47084 519 aa3.21□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C CSE4P36012 229 aa3.21□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C BOI2P39969 1040 aa3.21□□□□□ -1.9
HAL9YOL089C TDA6Q06466 467 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms