RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP15	YMR093W	FIG4	P42837	879 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	MRX12	P47084	519 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	RIM21	P48565	533 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	ATG3	P40344	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	MRX10	Q05648	414 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.04	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	VAC17	P25591	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	TTI1	P36097	1038 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	FRA1	Q07825	749 aa		5.03	□□□□□ -1.6
UTP15	YMR093W	EMP47	P43555	445 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	SDH2	P21801	266 aa		5.02	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	CPS1	P27614	576 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	YPR084W	Q06821	456 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	ENV9	Q08651	330 aa		5.01	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	KIP2	P28743	706 aa		5	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	ISF1	P32488	338 aa		5	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	IXR1	P33417	597 aa		5	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	BDP1	P46678	594 aa		5	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	AMS1	P22855	1083 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	PEP12	P32854	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	CST6	P40535	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	PUS5	Q06244	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	APL6	P46682	809 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UTP15	YMR093W	TGL4	P36165	910 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	SOH1	P38633	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	HED1	Q03937	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	GEF1	P37020	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	PUP1	P25043	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	ATG20	Q07528	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	RTT106	P40161	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	KTR7	P40504	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	GAL2	P13181	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	HAP4	P14064	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	PHO87	P25360	923 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	APP1	P53933	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	ITT1	Q04638	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UTP15	YMR093W	RAS1	P01119	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	MKS1	P34072	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	ECM23	Q02710	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	FBP26	P32604	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	TSC13	Q99190	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	CDC4	P07834	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	ISU1	Q03020	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	YML083C	Q04526	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
UTP15	YMR093W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	MIP1	P15801	1254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	YBL086C	P38177	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	UBX7	P38349	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	GAS4	Q08271	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	UTR2	P32623	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	HDA3	Q06623	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	STE6	P12866	1290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	TBS1	P38114	1094 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	CLA4	P48562	842 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	HST3	P53687	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	BDS1	Q08347	646 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	MET32	Q12041	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	DFG5	Q05031	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	AFT1	P22149	690 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	NTH2	P35172	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	ROM1	P53046	1155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTP15	YMR093W	VAN1	P23642	535 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	UGA3	P26370	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	ASH1	P34233	588 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	SLX8	P40072	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	WTM2	Q12206	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	TRS33	Q99394	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	CYT1	P07143	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	ARG82	P07250	355 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	SWI5	P08153	709 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UTP15	YMR093W	UBP1	P25037	809 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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