RNA–Protein interactions for RNA: YKL018C-A

YKL018C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL018C-A, Length 300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL018C-AYKL018C-A ENV9Q08651 330 aa8.6□□□□□ -1.03
YKL018C-AYKL018C-A RPO41P13433 1351 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
YKL018C-AYKL018C-A RSF2P46974 1380 aa8.6□□□□□ -1.03
YKL018C-AYKL018C-A TRK1P12685 1235 aa8.58□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A MAK11P20484 414 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A IMH1Q06704 911 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A PAP2P53632 584 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A MAM3Q12296 706 aa8.57□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A RIM15P43565 1770 aa8.57□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A DCD1P06773 312 aa8.54□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A MRM1P25270 412 aa8.54□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A XKS1P42826 600 aa8.54□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A IES2P40154 320 aa8.53□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YKL018C-AYKL018C-A SIR4P11978 1358 aa8.52□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A ROM2P51862 1356 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A RPP0P05317 312 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A GLC3P32775 704 aa8.52□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A RTR1P40084 226 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A AKL1P38080 1108 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data8.5□□□□□ -1.05not detected
YKL018C-AYKL018C-A CTF4Q01454 927 aa8.5□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A MEC3Q02574 474 aa8.5□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A BCH2P36122 765 aa8.49□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A RCR1P38212 213 aa8.48□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A DSD1P53095 428 aa8.48□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A RRP46P53256 223 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A ATF2P53296 535 aa8.48□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A EDE1P34216 1381 aa8.48□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A HSP104P31539 908 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A VPS27P40343 622 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A YDL144CQ07589 356 aa8.47□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A YRF1-4O13559 1382 aa8.47□□□□□ -1.05
YKL018C-AYKL018C-A YKL133CP36066 463 aa8.46□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A PRD1P25375 712 aa8.45□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.45□□□□□ -1.06 RIP-Chip
YKL018C-AYKL018C-A HPC2Q01448 625 aa8.45□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A CDC45Q08032 650 aa8.45□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A EPS1P40557 701 aa8.44□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A MPP10P47083 593 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A YMR074CQ04773 145 aa8.44□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A AOS1Q06624 347 aa8.44□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A COQ8P27697 501 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A NTH2P35172 780 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A GUA1P38625 525 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A DOT5P40553 215 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A PRY3P47033 881 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A YNL050CP53952 270 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A LAM6Q08001 693 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A GLN1P32288 370 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A PRS1P32895 427 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A BRL1P38770 471 aa8.41□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A YRB30P53107 440 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A ATG13Q06628 738 aa8.41□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A INP54Q08227 384 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A UBP1P25037 809 aa8.4□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A CDC27P38042 758 aa8.4□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A YJL181WP46987 611 aa8.4□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A ADE16P54113 591 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A FOX2Q02207 900 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
YKL018C-AYKL018C-A NUP145P49687 1317 aa8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A SSA1P10591 642 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A KCC4P25389 1037 aa8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A UGA3P26370 528 aa8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A PRP40P33203 583 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A MAM1P40065 302 aa8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A THI22Q06490 572 aa8.39□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A OSM1P21375 501 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A DIT2P21595 489 aa8.38□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A SAP155P43612 1002 aa8.38□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A NUP42P49686 430 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A ZDS1P50111 915 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A COBP00163 385 aa8.37□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A TPD3P31383 635 aa8.37□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A YML020WQ03722 664 aa8.37□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A NSE3Q05541 303 aa8.37□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A UTP10P42945 1769 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A LYS2P07702 1392 aa8.36□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A SUI2P20459 304 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A GEF1P37020 779 aa8.36□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A YBP2P53169 641 aa8.36□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A COX6P00427 148 aa8.35□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A YKR075CP36155 307 aa8.35□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A SLX8P40072 274 aa8.35□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A RPN11P43588 306 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A GYP7P48365 746 aa8.35□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A HEF3P53978 1044 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A RTT109Q07794 436 aa8.35□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A SSA2P10592 639 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A BDF1P35817 686 aa8.34□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A RVB2Q12464 471 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YKL018C-AYKL018C-A BUD31P25337 157 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YKL018C-AYKL018C-A GRX1P25373 110 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YKL018C-AYKL018C-A RRT14P40470 206 aa8.32□□□□□ -1.08
YKL018C-AYKL018C-A RMT2Q03305 412 aa8.32□□□□□ -1.08
YKL018C-AYKL018C-A TFB3Q03290 321 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.4 ms