RNA–Protein interactions for RNA: YHR184W

SSP1, Transcript of Protein involved in the control of meiotic nuclear division, yeast

Gene SSP1, Length 1,716 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP1	YHR184W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	EMP47	P43555	445 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	YML020W	Q03722	664 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	ALR1	Q08269	859 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	PEP12	P32854	288 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	TGL4	P36165	910 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	TEC1	P18412	486 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	KTR7	P40504	517 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	FIG4	P42837	879 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	KXD1	P53158	218 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	ENV9	Q08651	330 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	GUT2	P32191	649 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SSP1	YHR184W	HXT10	P43581	546 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	ECM23	Q02710	187 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	FRA1	Q07825	749 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
SSP1	YHR184W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	GYP1	Q08484	637 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	MRX12	P47084	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	MOD5	P07884	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	GAL2	P13181	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	VAC17	P25591	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	TPD3	P31383	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	SOH1	P38633	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	ATG3	P40344	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	SAS4	Q04003	481 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	UBX7	P38349	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	APL6	P46682	809 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	ITT1	Q04638	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSP1	YHR184W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	HAT1	Q12341	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	PHO87	P25360	923 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	IXR1	P33417	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	KIP2	P28743	706 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	PUS5	Q06244	254 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	HAP4	P14064	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	SLD2	P34252	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	SDH2	P21801	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	BDP1	P46678	594 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	ROM1	P53046	1155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	ATG20	Q07528	640 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
SSP1	YHR184W	TSC13	Q99190	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	MIP1	P15801	1254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	APP1	P53933	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	AMS1	P22855	1083 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	HDA3	Q06623	655 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SSP1	YHR184W	CST6	P40535	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	GAS4	Q08271	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	KAR5	Q04746	504 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	PUN1	Q06991	263 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	VAN1	P23642	535 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	NTH2	P35172	780 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	ERP5	P38819	212 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	PNP1	Q05788	311 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	SRS2	P12954	1174 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	MKS1	P34072	584 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	ISU1	Q03020	165 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	FBP26	P32604	452 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	UTR2	P32623	467 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	TRS33	Q99394	268 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	SWI5	P08153	709 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	BOL3	P39724	118 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	CYT1	P07143	309 aa		4.46	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	HEM3	P28789	327 aa		4.46	□□□□□ -1.69
SSP1	YHR184W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 372.1 ms