RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 THSD4Q6ZMP0 1018 aa13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-204ENST00000620385 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.14□□□□□ -0.31
CTXN3-204ENST00000620385 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.13□□□□□ -0.31
CTXN3-204ENST00000620385 RGS20O76081 388 aa13.11□□□□□ -0.31
CTXN3-204ENST00000620385 FOSBP53539 338 aa13.09□□□□□ -0.31
CTXN3-204ENST00000620385 A0A0G2JS52 829 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.08□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
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CTXN3-204ENST00000620385 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 PTPREP23469 700 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 WNT2BQ93097 391 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.06□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 GOLGA8CPA6NN73 597 aa13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.03□□□□□ -0.32
CTXN3-204ENST00000620385 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CTXN3-204ENST00000620385 CUX1P39880 1505 aa13.01□□□□□ -0.33
CTXN3-204ENST00000620385 JPH4Q96JJ6 628 aa13□□□□□ -0.33
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CTXN3-204ENST00000620385 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
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CTXN3-204ENST00000620385 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.98□□□□□ -0.33
CTXN3-204ENST00000620385 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.97□□□□□ -0.33
CTXN3-204ENST00000620385 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.97□□□□□ -0.33
CTXN3-204ENST00000620385 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.97□□□□□ -0.33
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CTXN3-204ENST00000620385 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.93□□□□□ -0.34
CTXN3-204ENST00000620385 KIF27Q86VH2 1401 aa12.92□□□□□ -0.34
CTXN3-204ENST00000620385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.91□□□□□ -0.34
CTXN3-204ENST00000620385 CEP162Q5TB80 1403 aa12.91□□□□□ -0.34
CTXN3-204ENST00000620385 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CTXN3-204ENST00000620385 PDE4AP27815 886 aa12.89□□□□□ -0.35
CTXN3-204ENST00000620385 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CTXN3-204ENST00000620385 PROX2Q3B8N5 592 aa12.88□□□□□ -0.35
CTXN3-204ENST00000620385 PRXQ9BXM0 1461 aa12.87□□□□□ -0.35
CTXN3-204ENST00000620385 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa12.87□□□□□ -0.35
CTXN3-204ENST00000620385 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.86□□□□□ -0.35
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CTXN3-204ENST00000620385 WDR97A6NE52 1622 aa12.86□□□□□ -0.35
CTXN3-204ENST00000620385 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.86□□□□□ -0.35
CTXN3-204ENST00000620385 COL9A1P20849 921 aa12.85□□□□□ -0.35
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CTXN3-204ENST00000620385 CUL7Q14999 1698 aa12.84□□□□□ -0.35
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.84□□□□□ -0.35
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CTXN3-204ENST00000620385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.84□□□□□ -0.35
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CTXN3-204ENST00000620385 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
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CTXN3-204ENST00000620385 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.81□□□□□ -0.36
CTXN3-204ENST00000620385 TOPBP1Q92547 1522 aa12.81□□□□□ -0.36
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CTXN3-204ENST00000620385 SOWAHBA6NEL2 793 aa12.79□□□□□ -0.36
CTXN3-204ENST00000620385 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.78□□□□□ -0.36
CTXN3-204ENST00000620385 Q6ZNB5 142 aa12.78□□□□□ -0.36
CTXN3-204ENST00000620385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.77□□□□□ -0.36
CTXN3-204ENST00000620385 MFSD10Q14728 455 aa12.77□□□□□ -0.37
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CTXN3-204ENST00000620385 WBP1LQ9NX94 342 aa12.76□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 CLIP1P30622 1438 aa12.76□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 CUX2O14529 1486 aa12.76□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.75□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.74□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.74□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.74□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
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CTXN3-204ENST00000620385 FBXW7Q969H0 707 aa12.72□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 NESP48681 1621 aa12.72□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.71□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 PHF14O94880 888 aa12.71□□□□□ -0.37
CTXN3-204ENST00000620385 KCNC4Q03721 635 aa12.71□□□□□ -0.37
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CTXN3-204ENST00000620385 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.68□□□□□ -0.38
CTXN3-204ENST00000620385 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.67□□□□□ -0.38
CTXN3-204ENST00000620385 LCE2BO14633 110 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-204ENST00000620385 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-204ENST00000620385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CTXN3-204ENST00000620385 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
CTXN3-204ENST00000620385 HRCP23327 699 aa12.65□□□□□ -0.38
CTXN3-204ENST00000620385 WDR62O43379 1518 aa12.65□□□□□ -0.38
CTXN3-204ENST00000620385 PBRM1Q86U86 1689 aa12.64□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.63□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 IGF1RP08069 1367 aa12.63□□□□□ -0.39
CTXN3-204ENST00000620385 ARAP1Q96P48 1450 aa12.62□□□□□ -0.39
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