RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-204ENST00000558666 DPYSL4O14531 572 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 EVI5O60447 810 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 CHD1O14646 1710 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K9P80192 1104 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 PBRM1Q86U86 1689 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 PDIA6Q15084 440 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 WDR97A6NE52 1622 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 ABCC8Q09428 1581 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 JPH4Q96JJ6 628 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 TOPBP1Q92547 1522 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 FOSBP53539 338 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-204ENST00000558666 PBX2P40425 430 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 P3H3Q8IVL6 736 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 CUX1P39880 1505 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 POTEEQ6S8J3 1075 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 SYNJ1O43426 1573 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 PTGER2P43116 358 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 PHF14O94880 888 aa7.59□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.59□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.59□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.59□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.59□□□□□ -1.19
TMOD3-204ENST00000558666 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGAP33O14559 1287 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 DDX12PQ92771 950 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 FBXW7Q969H0 707 aa7.57□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 KCNK17Q96T54 332 aa7.57□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 PSEN2P49810 448 aa7.56□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 EPAS1Q99814 870 aa7.56□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 TOP2BQ02880 1626 aa7.56□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 PTPREP23469 700 aa7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 NBR1Q14596 966 aa7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 KCNH8Q96L42 1107 aa7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 IFT140Q96RY7 1462 aa7.55□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.53□□□□□ -1.2
TMOD3-204ENST00000558666 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.52□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 TK2O00142 265 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K7O43318 606 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 OSBPP22059 807 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 SEMA3EO15041 775 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 COL9A1P20849 921 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 ADAMTS12P58397 1594 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 SOGA1O94964 1423 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 MMRN1Q13201 1228 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.47□□□□□ -1.21
TMOD3-204ENST00000558666 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 HRO43593 1189 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 PROX2Q3B8N5 592 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 CEP170Q5SW79 1584 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TMOD3-204ENST00000558666 GRIN2BQ13224 1484 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms