RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC4A3P48751 1232 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-217ENST00000510204 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
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SH3BP2-217ENST00000510204 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 NAIPQ13075 1403 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 WWC1Q8IX03 1113 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 MAP7D2Q96T17 732 aa15.18■□□□□ 0.02
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SH3BP2-217ENST00000510204 ARID3AQ99856 593 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 RIPK4P57078 832 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa15.16■□□□□ 0.02
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SH3BP2-217ENST00000510204 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.15■□□□□ 0.02
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SH3BP2-217ENST00000510204 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 ZBTB22O15209 634 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.14■□□□□ 0.01
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SH3BP2-217ENST00000510204 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.13■□□□□ 0.01
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SH3BP2-217ENST00000510204 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.12■□□□□ 0.01
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SH3BP2-217ENST00000510204 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.11■□□□□ 0.01
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SH3BP2-217ENST00000510204 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
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SH3BP2-217ENST00000510204 MIA2Q96PC5 1412 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP2-217ENST00000510204 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM193AP78312 1265 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 NGEFQ8N5V2 710 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 FSD2A1L4K1 749 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 CLGNO14967 610 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
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SH3BP2-217ENST00000510204 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 PSEN1P49768 467 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 APPP05067 770 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 TAF3Q5VWG9 929 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 SAMD9Q5K651 1589 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-217ENST00000510204 KIF15Q9NS87 1388 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 KDM6BO15054 1643 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 TERF1P54274 439 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 FAM161AQ3B820 660 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-217ENST00000510204 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.95□□□□□ -0.02
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